More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4920 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 328 aa  636    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  89.02 
 
 		 327 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  78.86 
 
 		 354 aa  485  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  79.05 
 
 		 349 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  78.23 
 
 		 342 aa  481  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  80.91 
 
 		 339 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  60.12 
 
 		 349 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  52.8 
 
 		 341 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  52.37 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 341 aa  312  3.9999999999999997e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  53.89 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  53.46 
 
 		 341 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  53.46 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  50.94 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  51.96 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  52.44 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  49.37 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  50.3 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 323 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  38.8 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  34.56 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.02 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  34.24 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35.74 
 
 		 312 aa  149  9e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  33.1 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  33.45 
 
 		 307 aa  146  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  37.01 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  35.1 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  32.32 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  36.65 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  37.85 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  32.61 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  33.02 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 312 aa  119  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  32.06 
 
 		 336 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 330 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 212 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  35.07 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 326 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 		 420 aa  92.8  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  28.23 
 
 		 206 aa  92  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 206 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.16 
 
 		 207 aa  89  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  23.6 
 
 		 207 aa  85.9  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  29.41 
 
 		 355 aa  76.3  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.64 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 120 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  42.7 
 
 		 117 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 		 125 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.84 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.71 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  29.85 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  50.67 
 
 		 131 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.4 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  48.05 
 
 		 124 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.27 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  30.25 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  48.1 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  33.74 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.84 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.179715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>