208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4881 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 743 aa  1329    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  65.14 
 
 		 1219 aa  301  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  53.98 
 
 		 842 aa  299  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  60.37 
 
 		 936 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  58.92 
 
 		 815 aa  286  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  55.78 
 
 		 748 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  58.69 
 
 		 1055 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  52.26 
 
 		 706 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  61.98 
 
 		 1168 aa  278  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  59 
 
 		 1147 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  55.53 
 
 		 813 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  59.75 
 
 		 712 aa  261  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  65.76 
 
 		 848 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  49.03 
 
 		 1580 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  57.22 
 
 		 459 aa  249  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  56.27 
 
 		 462 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  59.47 
 
 		 512 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  61.36 
 
 		 1451 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  35.95 
 
 		 1408 aa  239  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  62.77 
 
 		 643 aa  226  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  48.1 
 
 		 2914 aa  224  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  44.28 
 
 		 1321 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  44.59 
 
 		 835 aa  221  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  42.24 
 
 		 835 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  47.07 
 
 		 1170 aa  213  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  43.4 
 
 		 838 aa  210  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  42.71 
 
 		 835 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  56.01 
 
 		 639 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  62.33 
 
 		 585 aa  205  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  42.63 
 
 		 951 aa  202  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.69 
 
 		 934 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  48.59 
 
 		 867 aa  201  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  44.23 
 
 		 1297 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  67.21 
 
 		 606 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  49.74 
 
 		 465 aa  191  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  51.35 
 
 		 493 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  34.57 
 
 		 1873 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  53.97 
 
 		 524 aa  172  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  39.52 
 
 		 835 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  37.45 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  45.18 
 
 		 460 aa  161  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  48.82 
 
 		 516 aa  159  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  48.26 
 
 		 647 aa  158  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  50.14 
 
 		 426 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  47.39 
 
 		 300 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  44.72 
 
 		 342 aa  153  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  44.12 
 
 		 308 aa  152  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  45.21 
 
 		 594 aa  152  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  42.63 
 
 		 1050 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  42.11 
 
 		 542 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  44.68 
 
 		 738 aa  146  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  43.68 
 
 		 346 aa  144  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  69.05 
 
 		 348 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  56.6 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  42.25 
 
 		 346 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  42.66 
 
 		 641 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  40 
 
 		 465 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  40.76 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  58.88 
 
 		 481 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  58.88 
 
 		 478 aa  134  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  44 
 
 		 319 aa  134  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  41.97 
 
 		 447 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  42.35 
 
 		 343 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  43.84 
 
 		 1503 aa  131  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  43.11 
 
 		 322 aa  130  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  44.64 
 
 		 452 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  52.11 
 
 		 582 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  41.18 
 
 		 442 aa  127  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  41.52 
 
 		 645 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  65.28 
 
 		 326 aa  125  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  44.95 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  46.89 
 
 		 252 aa  124  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  68.38 
 
 		 380 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  44.85 
 
 		 363 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  46.12 
 
 		 468 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  46.58 
 
 		 466 aa  122  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  46.15 
 
 		 587 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  42.94 
 
 		 418 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  61.29 
 
 		 474 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  31.49 
 
 		 644 aa  115  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  42.37 
 
 		 403 aa  114  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  43.61 
 
 		 444 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  73.21 
 
 		 347 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  73.21 
 
 		 347 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  39.33 
 
 		 283 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  36.36 
 
 		 382 aa  108  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  42.35 
 
 		 582 aa  106  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  43.81 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  39.91 
 
 		 298 aa  105  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 473 aa  103  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  49.37 
 
 		 523 aa  100  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  27.16 
 
 		 2851 aa  99  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  43.18 
 
 		 493 aa  98.2  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  51.39 
 
 		 1101 aa  97.4  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  67.27 
 
 		 274 aa  97.4  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  40.44 
 
 		 266 aa  96.3  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  35.81 
 
 		 273 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  40.44 
 
 		 266 aa  95.5  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.04 
 
 		 689 aa  94  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  36.3 
 
 		 950 aa  92  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>