57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4705 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4189  hypothetical protein  86.21 
 
 		 116 aa  180  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  55.56 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  55.56 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3239  hypothetical protein  58.62 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  64.84 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1676  chemotactic signal-response protein CheL  45.57 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1110  chemotactic signal-response protein CheL  42.68 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.250313  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4433  chemotactic signal-response protein CheL  43.42 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3795  chemotactic signal-response protein CheL  42.31 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0896141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1343  chemotactic signal-response protein CheL  40.74 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1496  chemotactic signal-response protein CheL  37.97 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  38.96 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  41.89 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  45.33 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5521  chemotactic signal-response protein CheL  37.88 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  34.25 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  32.71 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  29.59 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  36.62 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  34.57 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  36.62 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  30.85 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  37.31 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  29.9 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  31.33 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1505  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  34.72 
 
 		 430 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  28.92 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0248  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  31.65 
 
 		 310 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0704  hypothetical protein  36.23 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0409683  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0350  flagellar protein flgJ  28.57 
 
 		 361 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0592688  normal  0.0502498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0693  hypothetical protein  36.23 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3277  flagellar protein FlgJ-like protein  34.72 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3723  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.05 
 
 		 388 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  23.46 
 
 		 388 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4382  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.43 
 
 		 384 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  23 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4292  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.26 
 
 		 400 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.615519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2842  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  28.21 
 
 		 394 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.948004  normal  0.211592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50380  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.26 
 
 		 400 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0038351  hitchhiker  0.00140941 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  23.19 
 
 		 605 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1473  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  33.33 
 
 		 384 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0415846  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3943  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  32.43 
 
 		 384 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1664  hypothetical protein  36.14 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.516137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3472  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  29.07 
 
 		 414 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.603408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  25.35 
 
 		 610 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3096  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1466  flagellar biosynthesis  26.47 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3099  hypothetical protein  23.26 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1008  flagellar protein, putative  28.57 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0667  hypothetical protein  31.76 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3786  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  23.61 
 
 		 332 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4783  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.26 
 
 		 361 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.186683 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3706  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  30.26 
 
 		 361 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.537792  normal  0.0583488 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2916  flagellar rod assembly protein/muramidase FlgJ  27.4 
 
 		 352 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.110406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0598  Flagellar protein FlgJ-like protein  30.26 
 
 		 109 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>