115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4676 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3967  hypothetical protein  84.97 
 
 		 752 aa  1267    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.154728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4676  protein of unknown function DUF181  100 
 
 		 752 aa  1523    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5737  protein of unknown function DUF181  38.1 
 
 		 750 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1788  hypothetical protein  37.96 
 
 		 746 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2355  hypothetical protein  38.34 
 
 		 769 aa  486  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.247728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0519  protein of unknown function DUF181  39.22 
 
 		 762 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0880  hypothetical protein  37.23 
 
 		 749 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2767  protein of unknown function DUF181  39.86 
 
 		 757 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128011  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4992  hypothetical protein  33.55 
 
 		 745 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.934351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4504  hypothetical protein  33.11 
 
 		 745 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4368  hypothetical protein  35.39 
 
 		 727 aa  326  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150776 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 745 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.535305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5136  hypothetical protein  33.38 
 
 		 745 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00343987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5723  hypothetical protein  33.38 
 
 		 745 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250134  normal  0.533402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0517  hypothetical protein  32.95 
 
 		 756 aa  310  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11147  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0622  hypothetical protein  32.78 
 
 		 769 aa  310  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.940579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0802  AknN  32.91 
 
 		 844 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.919252  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2214  hypothetical protein  32.69 
 
 		 763 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2493  hypothetical protein  32.69 
 
 		 763 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2869  hypothetical protein  32.56 
 
 		 763 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0637  YcaO-like fatty acid binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 766 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0023  hypothetical protein  33.11 
 
 		 716 aa  287  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3061  hypothetical protein  34.57 
 
 		 736 aa  258  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493225  normal  0.24084 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0958  hypothetical protein  25.53 
 
 		 650 aa  147  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1163  hypothetical protein  25.98 
 
 		 649 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0353  protein of unknown function DUF181  24.88 
 
 		 647 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.742024  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0555  hypothetical protein  26.56 
 
 		 657 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0821  hypothetical protein  29.13 
 
 		 424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1415  hypothetical protein  28.57 
 
 		 649 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1337  hypothetical protein  29.67 
 
 		 649 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.85919e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1155  hypothetical protein  29.67 
 
 		 649 aa  129  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1174  hypothetical protein  29.43 
 
 		 649 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1267  hypothetical protein  29.43 
 
 		 649 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1311  hypothetical protein  29.12 
 
 		 649 aa  127  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.705807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1377  hypothetical protein  28.67 
 
 		 649 aa  127  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1149  hypothetical protein  29.43 
 
 		 649 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4033  hypothetical protein  28.27 
 
 		 649 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1333  hypothetical protein  31.47 
 
 		 404 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2590  hypothetical protein  25.47 
 
 		 630 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188065  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4207  protein of unknown function DUF181  26.3 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4201  protein of unknown function DUF181  26.71 
 
 		 647 aa  111  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2435  hypothetical protein  25.13 
 
 		 630 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0806076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0527  hypothetical protein  27.54 
 
 		 406 aa  109  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.518429 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0591  NADPH-dependent FMN reductase  29.94 
 
 		 403 aa  109  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0069008  hitchhiker  0.000778526 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1978  hypothetical protein  26.98 
 
 		 403 aa  108  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.154455  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3690  protein of unknown function DUF181  25.94 
 
 		 669 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2583  hypothetical protein  25.34 
 
 		 607 aa  108  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1401  hypothetical protein  29.13 
 
 		 403 aa  107  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2428  hypothetical protein  25.64 
 
 		 641 aa  106  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2069  hypothetical protein  26.55 
 
 		 426 aa  106  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2237  hypothetical protein  31.3 
 
 		 397 aa  104  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3696  protein of unknown function DUF181  26.24 
 
 		 644 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3864  protein of unknown function DUF181  28.99 
 
 		 566 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000134117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0413  hypothetical protein  26.3 
 
 		 584 aa  101  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3716  hypothetical protein  27.81 
 
 		 438 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0842  hypothetical protein  24.21 
 
 		 404 aa  93.6  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0167577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  27.94 
 
 		 575 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0379  hypothetical protein  28.09 
 
 		 403 aa  91.7  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1028  hypothetical protein  28.86 
 
 		 575 aa  90.1  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4196  hypothetical protein  29.27 
 
 		 436 aa  88.6  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6037  protein of unknown function DUF181  29.62 
 
 		 420 aa  87.4  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.463338  normal  0.501056 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0310  hypothetical protein  23.68 
 
 		 400 aa  87.4  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3472  hypothetical protein  27.14 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1602  methanogenesis marker protein 1  24.57 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.192531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1211  methanogenesis marker protein 1  27.41 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.882639 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0537  hypothetical protein  23.7 
 
 		 400 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0125337  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7195  protein of unknown function DUF181  29.14 
 
 		 420 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175202  normal  0.168527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2348  hypothetical protein  28.02 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.119117  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0608  protein of unknown function DUF181  27.65 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4234  hypothetical protein  27.65 
 
 		 466 aa  80.1  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0004  protein of unknown function DUF181  27.95 
 
 		 584 aa  77  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0544869 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0244  protein of unknown function DUF181  29.15 
 
 		 555 aa  76.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1835  hypothetical protein  27.67 
 
 		 585 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.444431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1001  protein of unknown function DUF181  26.53 
 
 		 580 aa  75.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2261  hypothetical protein  26.99 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00608727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1373  hypothetical protein  28.32 
 
 		 635 aa  75.1  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000799529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2211  hypothetical protein  27.04 
 
 		 404 aa  73.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.471647  normal  0.108179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1738  protein of unknown function DUF181  30.61 
 
 		 572 aa  73.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.858461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6310  protein of unknown function DUF181  25.06 
 
 		 443 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4198  hypothetical protein  27.01 
 
 		 644 aa  72.4  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  25.6 
 
 		 572 aa  72  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0917  hypothetical protein  29.15 
 
 		 437 aa  72  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  28.76 
 
 		 882 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6320  hypothetical protein  30.28 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21234  normal  0.37052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2957  protein of unknown function DUF181  26.71 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3205  protein of unknown function DUF181  26.82 
 
 		 391 aa  62  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0013  hypothetical protein  25.82 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.077067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3119  protein of unknown function DUF181  25.87 
 
 		 590 aa  60.1  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0048478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2408  hypothetical protein  25.15 
 
 		 573 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0656  protein of unknown function DUF181  23.08 
 
 		 600 aa  59.7  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0009  hypothetical protein  26.69 
 
 		 353 aa  56.6  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.264047  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6106  hypothetical protein  26.79 
 
 		 405 aa  53.5  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0977639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3580  hypothetical protein  22.95 
 
 		 618 aa  51.6  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000420617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1064  protein of unknown function DUF181  23.99 
 
 		 604 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000107969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1021  protein of unknown function DUF181  26.21 
 
 		 486 aa  50.8  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3717  hypothetical protein  27.97 
 
 		 353 aa  51.2  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.295306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0840  hypothetical cytosolic protein  23.81 
 
 		 416 aa  51.2  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2174  hypothetical protein  26.73 
 
 		 728 aa  50.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2073  hypothetical protein  29.25 
 
 		 734 aa  49.7  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1146  hypothetical protein  28.26 
 
 		 732 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202327  normal  0.214349 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>