294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4615 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
238 aa  473  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  91.58 
 
 
201 aa  364  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  71.07 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  73.08 
 
 
257 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  72.53 
 
 
251 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  72.53 
 
 
251 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  58.47 
 
 
262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  59.32 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  55.56 
 
 
263 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  60.73 
 
 
286 aa  208  6e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  56.91 
 
 
259 aa  208  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  58.89 
 
 
219 aa  205  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  59.78 
 
 
224 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  58.89 
 
 
219 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  56.57 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  60.47 
 
 
220 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  58.48 
 
 
205 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  60.57 
 
 
253 aa  198  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  52.56 
 
 
314 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  56.32 
 
 
260 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  50.85 
 
 
201 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  52.63 
 
 
201 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  57.89 
 
 
279 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  52.22 
 
 
204 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  53.11 
 
 
209 aa  181  6e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  52.36 
 
 
207 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  46.51 
 
 
204 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  45.09 
 
 
206 aa  158  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  47.34 
 
 
194 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  44.19 
 
 
204 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  44.19 
 
 
204 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  47.62 
 
 
196 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  44.13 
 
 
203 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  48.37 
 
 
207 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  37.86 
 
 
225 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  45.45 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  46.88 
 
 
186 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  46.15 
 
 
186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  43.93 
 
 
178 aa  126  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  44.89 
 
 
181 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  42.42 
 
 
199 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0177  hypothetical protein  39.86 
 
 
153 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00695056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1063  hypothetical protein  39.86 
 
 
153 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295932  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1738  hypothetical protein  39.86 
 
 
153 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00684436  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2566  hypothetical protein  39.86 
 
 
153 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000987168  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0989  hypothetical protein  39.86 
 
 
153 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.233502  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1760  hypothetical protein  39.86 
 
 
153 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0659337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1509  hypothetical protein  39.86 
 
 
153 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.985298  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1018  hypothetical protein  39.19 
 
 
152 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1474  hypothetical protein  39.19 
 
 
152 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150708  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1498  hypothetical protein  39.19 
 
 
152 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1913  hypothetical protein  39.19 
 
 
153 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  44.54 
 
 
176 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4639  hypothetical protein  39.19 
 
 
152 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0564312  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1731  hypothetical protein  41.22 
 
 
152 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1757  hypothetical protein  39.86 
 
 
152 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.47468  normal  0.0284791 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  44.54 
 
 
151 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1420  hypothetical protein  38.51 
 
 
152 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.042517 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1630  hypothetical protein  39.86 
 
 
152 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00641879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1380  hypothetical protein  38.51 
 
 
152 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449131  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2822  hypothetical protein  39.19 
 
 
152 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00822471  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  36.49 
 
 
154 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  41.23 
 
 
169 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  37.11 
 
 
161 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  41.27 
 
 
153 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  41.23 
 
 
152 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  34.23 
 
 
153 aa  99.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  38.35 
 
 
152 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  39.07 
 
 
151 aa  98.6  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  38.35 
 
 
152 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  40.35 
 
 
169 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  40.35 
 
 
169 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  34.19 
 
 
151 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  34.46 
 
 
150 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  36.92 
 
 
158 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  34.46 
 
 
150 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  34.46 
 
 
150 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  35.14 
 
 
150 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  34.46 
 
 
154 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  34.46 
 
 
154 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  35.66 
 
 
151 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  32.47 
 
 
151 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  37.41 
 
 
140 aa  95.9  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2030  hypothetical protein  36.24 
 
 
162 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3348  protein of unknown function DUF150  34.72 
 
 
140 aa  95.5  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  36 
 
 
153 aa  95.5  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07810  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  95.1  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  33.55 
 
 
151 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  34.53 
 
 
151 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0596  hypothetical protein  32.47 
 
 
151 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.277868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>