More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4596 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
230 aa  457  1e-128  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  81.45 
 
 
228 aa  348  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.77 
 
 
226 aa  268  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.01 
 
 
225 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  57.47 
 
 
226 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.47 
 
 
226 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  56.56 
 
 
224 aa  258  8e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.92 
 
 
224 aa  215  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
222 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  40.19 
 
 
243 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.03 
 
 
236 aa  136  3e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
230 aa  135  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.09 
 
 
226 aa  130  2e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 
225 aa  128  7e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.07 
 
 
243 aa  127  1e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.07 
 
 
243 aa  127  1e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  37.61 
 
 
239 aa  124  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
227 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
231 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
225 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.5 
 
 
219 aa  121  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.07267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
227 aa  121  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.02 
 
 
226 aa  121  1e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
228 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  32.08 
 
 
225 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0351  putative transcriptional regulator  37.02 
 
 
228 aa  119  5e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.6 
 
 
236 aa  117  1e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
235 aa  117  2e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
235 aa  116  2e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41213e-05 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  34.52 
 
 
226 aa  117  2e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  32.43 
 
 
225 aa  116  4e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
227 aa  115  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.3 
 
 
225 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
227 aa  115  7e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.86 
 
 
225 aa  115  7e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.3 
 
 
220 aa  115  8e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  1.48221e-05 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 
242 aa  114  9e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  34.98 
 
 
224 aa  114  9e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2541  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
235 aa  114  1e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000812643  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1929  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
235 aa  114  1e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.589711  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.96 
 
 
228 aa  114  1e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  36 
 
 
235 aa  113  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0775  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
237 aa  113  2e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.92 
 
 
243 aa  114  2e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.96 
 
 
225 aa  114  2e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
225 aa  114  2e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.73 
 
 
239 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.72 
 
 
228 aa  112  4e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.49 
 
 
239 aa  112  4e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
229 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03580  putative transcriptional regulator  34.68 
 
 
228 aa  111  8e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000980911  hitchhiker  9.77836e-11 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.02 
 
 
226 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.9 
 
 
251 aa  111  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.16 
 
 
232 aa  110  1e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
239 aa  110  1e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 
228 aa  111  1e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
239 aa  111  1e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.02 
 
 
224 aa  110  1e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4353  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
227 aa  110  1e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5872  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
235 aa  111  1e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142608  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.38 
 
 
226 aa  110  2e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.32 
 
 
229 aa  110  2e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
239 aa  110  2e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.16 
 
 
243 aa  109  4e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
235 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.027549  normal  0.149867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  34.34 
 
 
225 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
233 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
238 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0027  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.91 
 
 
237 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
228 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
226 aa  105  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  32.55 
 
 
226 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7045  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.91 
 
 
237 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601598  normal  0.0108856 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.55 
 
 
225 aa  105  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.66 
 
 
225 aa  105  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
239 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
234 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.6 
 
 
226 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  33.8 
 
 
266 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 
225 aa  102  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 
225 aa  102  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
241 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2665  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
239 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0675619  normal  0.290328 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
246 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  29.46 
 
 
239 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
231 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.36 
 
 
225 aa  101  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
218 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.85636e-06  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 
223 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4881  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
278 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.484233  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1913  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
241 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.205993  normal  0.953786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
232 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.56 
 
 
231 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  30.58 
 
 
224 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  32.55 
 
 
235 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
235 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
235 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
241 aa  99.4  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.35 
 
 
228 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
234 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>