More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4585 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.02 
 
 
1596 aa  855  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1350 aa  2695  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.38 
 
 
1009 aa  615  1e-174  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.52 
 
 
984 aa  591  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 
1124 aa  563  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.81 
 
 
973 aa  516  1e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.72 
 
 
969 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  39.53 
 
 
1125 aa  483  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
1125 aa  477  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.29 
 
 
1157 aa  468  1e-130  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.66 
 
 
1362 aa  459  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
1120 aa  454  1e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  54.16 
 
 
737 aa  455  1e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  56.35 
 
 
900 aa  443  1e-122  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.62 
 
 
903 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 
1158 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.38 
 
 
873 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.61 
 
 
910 aa  392  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.79 
 
 
1560 aa  382  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1222 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.28 
 
 
524 aa  355  3e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
1603 aa  350  8e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.61 
 
 
1363 aa  348  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  41.13 
 
 
1023 aa  348  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
1116 aa  345  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  35.7 
 
 
982 aa  344  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
1433 aa  343  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 
765 aa  342  3e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
896 aa  342  3e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.07 
 
 
589 aa  340  8e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.35 
 
 
1121 aa  340  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  7.51372e-06 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
939 aa  339  2e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
1771 aa  338  4e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.16 
 
 
803 aa  337  9e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.16 
 
 
1069 aa  337  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.86 
 
 
882 aa  336  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
1229 aa  336  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.44 
 
 
850 aa  336  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 
932 aa  332  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.79 
 
 
866 aa  331  5e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
1075 aa  330  1e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 
785 aa  328  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.72 
 
 
738 aa  328  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.65 
 
 
902 aa  327  7e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1767 aa  327  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
1765 aa  326  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  39.75 
 
 
853 aa  325  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
1223 aa  325  5e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 
1767 aa  324  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1767 aa  324  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
1768 aa  324  8e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
1271 aa  324  8e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  32.64 
 
 
1765 aa  324  9e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  37.02 
 
 
2109 aa  324  9e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 
1452 aa  322  2e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
1059 aa  322  4e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.43 
 
 
1204 aa  321  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
919 aa  320  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  32.7 
 
 
1763 aa  319  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 
877 aa  320  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.86 
 
 
846 aa  319  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  43.58 
 
 
968 aa  319  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1627  histidine kinase  47.68 
 
 
538 aa  319  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 
1226 aa  317  1e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 
1195 aa  317  1e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 
895 aa  317  1e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
791 aa  315  3e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1064 aa  315  4e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
785 aa  314  7e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
916 aa  313  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
957 aa  312  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.48 
 
 
865 aa  312  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
1792 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 
864 aa  313  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
1782 aa  312  3e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1784 aa  312  3e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  48.27 
 
 
687 aa  311  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
969 aa  310  1e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.23 
 
 
1786 aa  310  1e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  38.53 
 
 
1028 aa  310  1e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.34 
 
 
695 aa  309  2e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 
947 aa  309  2e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  35.88 
 
 
797 aa  309  2e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 
764 aa  309  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.24 
 
 
876 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.11 
 
 
1313 aa  308  5e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  40.59 
 
 
793 aa  308  5e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 
1044 aa  308  5e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 
827 aa  308  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.77 
 
 
763 aa  306  1e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1407 aa  306  1e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
1499 aa  306  2e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.37 
 
 
873 aa  306  2e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.8 
 
 
817 aa  305  3e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 
1578 aa  305  5e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.27 
 
 
863 aa  303  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
1287 aa  303  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
945 aa  303  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  44.42 
 
 
729 aa  303  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
1369 aa  301  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>