253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4579 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  100 
 
 		 438 aa  832    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  76.64 
 
 		 439 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  58.35 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  38.79 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  37.74 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  36.7 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  35.6 
 
 		 420 aa  170  6e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  35.32 
 
 		 422 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  37.1 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  36.76 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  36.56 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  35.91 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  26.84 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  35.89 
 
 		 442 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  34.11 
 
 		 463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  36.01 
 
 		 419 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  26.53 
 
 		 495 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  35.66 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  35.77 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  34.02 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  33.41 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  35.24 
 
 		 430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  29.36 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  29.36 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  33.89 
 
 		 476 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  34.89 
 
 		 429 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  34.56 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  35.59 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  32.59 
 
 		 409 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  31.59 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  35.57 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  32.94 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  30.41 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  33.18 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  33.5 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  31.81 
 
 		 480 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  32.63 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  30.34 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  34.54 
 
 		 457 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  29.9 
 
 		 413 aa  113  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  33.65 
 
 		 434 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  33.17 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  27.07 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  27.52 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  33.99 
 
 		 469 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  31.9 
 
 		 485 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  33.88 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  26.78 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0071  twin-arginine translocation pathway signal  36.87 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  30.57 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  33.41 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  24.42 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  31.2 
 
 		 1199 aa  86.7  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  29.86 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  29.87 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  25.53 
 
 		 536 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  29.6 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  26.17 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  27.9 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  31.07 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  30.63 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  29.84 
 
 		 436 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  26.09 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  42.42 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46399  predicted protein  28.15 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.15 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  29.08 
 
 		 999 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.28 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  28.69 
 
 		 1274 aa  63.2  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.46 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  22.74 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  28.66 
 
 		 492 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  32.35 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  29.9 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  47.69 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  31.23 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  53.12 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  24.68 
 
 		 592 aa  57  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  43.48 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  30.57 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  29.27 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50.85 
 
 		 462 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  60 
 
 		 450 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  60 
 
 		 450 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  27.59 
 
 		 427 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  46.77 
 
 		 537 aa  53.1  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  64.29 
 
 		 454 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  32.61 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  42.86 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.26 
 
 		 657 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  25 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  25.21 
 
 		 616 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  32.06 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  63.41 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  26.32 
 
 		 365 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  46.77 
 
 		 492 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  26.51 
 
 		 624 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  38.89 
 
 		 491 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  49.23 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  35.34 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>