More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4574 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  67.93 
 
 
873 aa  1075  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4574  histidine kinase  100 
 
 
900 aa  1778  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3466  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.11 
 
 
1362 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.185791  normal  0.474676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  56.35 
 
 
1350 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.03 
 
 
1009 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.04 
 
 
1596 aa  419  1e-115  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.22 
 
 
1124 aa  416  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.05 
 
 
984 aa  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.47 
 
 
1157 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.56 
 
 
1125 aa  386  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  52.86 
 
 
1125 aa  386  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  55.37 
 
 
910 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.06 
 
 
1158 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 
903 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3783  histidine kinase  52.76 
 
 
737 aa  360  1e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  52.01 
 
 
1120 aa  358  2e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.09 
 
 
524 aa  359  2e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.31 
 
 
589 aa  343  9e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0113735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.15 
 
 
973 aa  339  1e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
1199 aa  338  3e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.51 
 
 
969 aa  337  6e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  44.26 
 
 
1560 aa  323  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.41 
 
 
866 aa  320  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1263  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.98 
 
 
687 aa  320  8e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.618033  normal  0.0213865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 
1433 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
1110 aa  318  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.93 
 
 
772 aa  315  2e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.08 
 
 
877 aa  311  3e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.59 
 
 
876 aa  311  3e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
873 aa  308  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 
817 aa  306  1e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  45.66 
 
 
729 aa  305  2e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
785 aa  305  2e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 
902 aa  304  4e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0307  response regulator, histidine kinase  37.67 
 
 
755 aa  304  4e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  41.35 
 
 
544 aa  304  6e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  44.21 
 
 
2109 aa  303  9e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3089  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  38.3 
 
 
856 aa  302  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.22 
 
 
781 aa  301  4e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.97 
 
 
895 aa  300  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
932 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3852  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 
879 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0452097  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
846 aa  299  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3743  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  51.05 
 
 
724 aa  298  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.3347  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
896 aa  298  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1627  histidine kinase  47.4 
 
 
538 aa  298  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3798  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
864 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.87 
 
 
1078 aa  296  9e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.96 
 
 
717 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0472  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  46.85 
 
 
517 aa  295  3e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  36.76 
 
 
786 aa  294  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  41.47 
 
 
1023 aa  294  6e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 
764 aa  293  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  44.56 
 
 
735 aa  293  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.38 
 
 
763 aa  293  1e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  40.44 
 
 
968 aa  293  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
843 aa  291  5e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.87 
 
 
860 aa  291  5e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
1223 aa  291  5e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  33.82 
 
 
794 aa  290  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.42 
 
 
765 aa  290  9e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.04 
 
 
880 aa  290  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0516  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.21 
 
 
850 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
863 aa  288  3e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4279  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.92 
 
 
951 aa  288  3e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.5 
 
 
645 aa  288  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 
1222 aa  287  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 
1059 aa  287  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
982 aa  287  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
738 aa  287  7e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.55 
 
 
1070 aa  286  9e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  43.13 
 
 
553 aa  286  1e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 
1127 aa  286  1e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3207  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
910 aa  285  2e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  39.85 
 
 
631 aa  285  3e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  36.45 
 
 
853 aa  285  3e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1933  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 
650 aa  285  3e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.77937  normal  0.846715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  43.26 
 
 
793 aa  285  3e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.3 
 
 
939 aa  285  3e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1877  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.38 
 
 
863 aa  284  5e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 
789 aa  284  5e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  44.76 
 
 
787 aa  284  5e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  41.11 
 
 
571 aa  284  6e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  43.87 
 
 
666 aa  284  6e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.45 
 
 
1358 aa  284  6e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
803 aa  283  7e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  41.32 
 
 
606 aa  283  7e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
1064 aa  283  7e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  40.96 
 
 
982 aa  283  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.65 
 
 
655 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.99 
 
 
1116 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.19 
 
 
1204 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 
882 aa  282  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  38.41 
 
 
736 aa  282  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 
947 aa  281  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 
957 aa  281  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1840  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 
641 aa  281  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.870294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.02 
 
 
674 aa  280  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 
1791 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4006  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.49 
 
 
782 aa  279  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>