More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4572 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  100 
 
 		 615 aa  1208    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  81.86 
 
 		 621 aa  890    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  48.51 
 
 		 681 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  49.05 
 
 		 676 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  46.29 
 
 		 674 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  46.5 
 
 		 656 aa  475  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  43.95 
 
 		 699 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  43.98 
 
 		 697 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  43.63 
 
 		 697 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  41.06 
 
 		 665 aa  422  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  39.65 
 
 		 695 aa  405  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  34.83 
 
 		 687 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  35.73 
 
 		 692 aa  335  1e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  36.35 
 
 		 690 aa  333  7.000000000000001e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  37.62 
 
 		 683 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  33.38 
 
 		 680 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  34.66 
 
 		 695 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  35.22 
 
 		 676 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  34.46 
 
 		 681 aa  321  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  35.71 
 
 		 651 aa  299  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  36.76 
 
 		 651 aa  298  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  36.76 
 
 		 651 aa  296  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  33.76 
 
 		 646 aa  292  2e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  35.43 
 
 		 646 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  33.23 
 
 		 640 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  32.86 
 
 		 640 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  36.28 
 
 		 645 aa  279  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  32.81 
 
 		 648 aa  275  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  43.43 
 
 		 569 aa  217  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  42.86 
 
 		 533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  44.36 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  37.35 
 
 		 474 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  37.06 
 
 		 475 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  37.06 
 
 		 473 aa  187  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  36.87 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  35.92 
 
 		 475 aa  186  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  36.36 
 
 		 503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  35.77 
 
 		 468 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  43.39 
 
 		 447 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  36.08 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  41.18 
 
 		 464 aa  180  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  33.51 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 577 aa  178  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.98 
 
 		 517 aa  177  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  42.62 
 
 		 472 aa  177  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  32.2 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  42.11 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  42.79 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  32.7 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  44.4 
 
 		 480 aa  170  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  32.39 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  57.97 
 
 		 287 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  40.78 
 
 		 524 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  42.59 
 
 		 471 aa  163  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  42.13 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  35.66 
 
 		 441 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  39.29 
 
 		 513 aa  161  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  38.24 
 
 		 741 aa  160  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.25 
 
 		 438 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  37.39 
 
 		 462 aa  159  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  30.71 
 
 		 479 aa  158  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.59 
 
 		 312 aa  156  9e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  35.42 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  31.78 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  48.8 
 
 		 435 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  28.19 
 
 		 470 aa  154  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  34.9 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  39.02 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  43.01 
 
 		 523 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  36.47 
 
 		 527 aa  151  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  34.87 
 
 		 448 aa  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  40.48 
 
 		 513 aa  150  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  34.56 
 
 		 429 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  42.94 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.1 
 
 		 441 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  42.68 
 
 		 402 aa  148  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.2 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  31.96 
 
 		 439 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  37.39 
 
 		 454 aa  147  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  37.39 
 
 		 454 aa  147  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  33.47 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  34.57 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  30.61 
 
 		 470 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  32.93 
 
 		 460 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  33.09 
 
 		 353 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  44.52 
 
 		 386 aa  144  5e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  43.87 
 
 		 386 aa  144  6e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  36.25 
 
 		 457 aa  144  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  34.22 
 
 		 465 aa  144  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  43.87 
 
 		 386 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  32.07 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  39.09 
 
 		 389 aa  141  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  32.34 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  35.47 
 
 		 464 aa  141  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  38.16 
 
 		 429 aa  140  6e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  37.89 
 
 		 353 aa  140  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  34.12 
 
 		 498 aa  140  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  34.02 
 
 		 490 aa  140  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  34.66 
 
 		 464 aa  140  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  39.2 
 
 		 441 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>