More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4546 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  100 
 
 		 311 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  86.45 
 
 		 312 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  80.68 
 
 		 311 aa  418  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  54.9 
 
 		 307 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  53.92 
 
 		 307 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  50.82 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  53.67 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  53.72 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  47.74 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  47.74 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  47.74 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  47.23 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  47.57 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  48.22 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  46.43 
 
 		 309 aa  266  4e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.45 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  45.78 
 
 		 310 aa  258  9e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  45.78 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  43.65 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  43.65 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  43.32 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.32 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  43.32 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.32 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.32 
 
 		 309 aa  248  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.32 
 
 		 309 aa  248  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.32 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.51 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.42 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.97 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  42.63 
 
 		 314 aa  228  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  46.56 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.98 
 
 		 331 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.66 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  44 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.24 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  46.28 
 
 		 290 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.14 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  35.93 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  40.94 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  40.6 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.6 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  35.55 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  43.85 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  43.31 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  42.65 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.33 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  39 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  43 
 
 		 302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.2 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  32.31 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  38.53 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  33.77 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  42.19 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  36.63 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.9 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  40.15 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.15 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  33.12 
 
 		 312 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  32.67 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  34.15 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  27.56 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  30.36 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.04 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  34.33 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  43.8 
 
 		 153 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  34.68 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  31.93 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.98 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  27.76 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  32.98 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  32.98 
 
 		 308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  31.97 
 
 		 339 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  32.98 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  32.5 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  31.54 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  34.44 
 
 		 309 aa  96.3  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  32.37 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  35.29 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  29.87 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  29.87 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  26.69 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.73 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  32.85 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  32.85 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  33.09 
 
 		 309 aa  92.8  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  32.17 
 
 		 312 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01490  putative ketodeoxygluconokinase  31.93 
 
 		 172 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.57 
 
 		 337 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  25.79 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  30.77 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  32.86 
 
 		 331 aa  89  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.49 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  34.41 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>