45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4528 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4528  acyltransferase 3  100 
 
 
357 aa  693    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.323845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3208  acyltransferase 3  80.44 
 
 
363 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3182  acyltransferase 3  69.36 
 
 
356 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.815834  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2598  acyltransferase 3  68.73 
 
 
372 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1197  acyltransferase 3  67.41 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1411  acyltransferase 3  67.92 
 
 
387 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1250  acyltransferase 3  68.47 
 
 
387 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.457932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7354  hypothetical protein  55.46 
 
 
350 aa  323  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351955  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4855  acyltransferase 3  50.29 
 
 
352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.520478  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0358  acyltransferase 3  53.08 
 
 
370 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0537  acyltransferase 3  51.01 
 
 
350 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0454  acyltransferase 3  52.79 
 
 
348 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0504  acyltransferase 3  51.58 
 
 
351 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0301  acyltransferase 3  52.06 
 
 
351 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0134  acyltransferase 3  48.41 
 
 
371 aa  265  7e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3072  acyltransferase 3  37.35 
 
 
351 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  38.15 
 
 
350 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0387  acyltransferase 3  30.51 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.819707  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21050  predicted membrane protein  29.24 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.851198  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1093  acyltransferase 3  25.58 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2951  acyltransferase 3  29.91 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.100604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02910  predicted membrane protein  26.78 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0740  acyltransferase 3  34.62 
 
 
431 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988663  hitchhiker  0.00725636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1630  acyltransferase 3  25.66 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00419884  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1495  putative acyltransferase  29.81 
 
 
357 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0187927  normal  0.449977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1237  hypothetical protein  29.19 
 
 
357 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000187356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2532  acyltransferase 3  29.19 
 
 
357 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000991638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01119  hypothetical protein  27.04 
 
 
357 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.168503  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01111  predicted inner membrane protein  27.04 
 
 
357 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.180967  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3702  acyltransferase 3  33.02 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00240595  normal  0.215938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2208  putative acyltransferase  29.19 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.162897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2011  putative acyltransferase  28.57 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.020428 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2486  acyltransferase 3  28.85 
 
 
357 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00152746  hitchhiker  0.00445696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1238  hypothetical protein  28.85 
 
 
357 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00200189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  26.12 
 
 
352 aa  53.5  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  30.53 
 
 
473 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  31.3 
 
 
435 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  31.3 
 
 
392 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  31.3 
 
 
392 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  30.53 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1240  acyltransferase 3  27.06 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  30.53 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  30.53 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0287  acyltransferase 3  30 
 
 
391 aa  46.2  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2204  acyltransferase 3  36.14 
 
 
389 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0240982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>