More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4494 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
320 aa  653  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  93.44 
 
 
320 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  83.91 
 
 
335 aa  548  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  84.64 
 
 
329 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  84.91 
 
 
328 aa  534  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  84.91 
 
 
328 aa  534  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  65.83 
 
 
363 aa  467  1e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  65.08 
 
 
358 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  64.23 
 
 
355 aa  455  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  67.16 
 
 
349 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  67.26 
 
 
347 aa  454  1e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  66.76 
 
 
345 aa  451  1e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  63.17 
 
 
353 aa  447  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  66.57 
 
 
350 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  65.69 
 
 
353 aa  446  1e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  64.39 
 
 
350 aa  441  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  63.19 
 
 
361 aa  437  1e-122  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  62.29 
 
 
355 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  66.03 
 
 
326 aa  417  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  61.93 
 
 
343 aa  407  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  56.35 
 
 
374 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  62.5 
 
 
320 aa  396  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  57.42 
 
 
364 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  56.41 
 
 
354 aa  388  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  62.66 
 
 
332 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  54.78 
 
 
367 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  55.3 
 
 
360 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  54.75 
 
 
369 aa  371  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  58.49 
 
 
323 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  58.75 
 
 
323 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  52.65 
 
 
365 aa  360  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  56.96 
 
 
323 aa  358  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  56.15 
 
 
323 aa  354  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  57.14 
 
 
323 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  57.14 
 
 
323 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  70.05 
 
 
393 aa  312  5e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  49.4 
 
 
337 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  50.47 
 
 
328 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  49.68 
 
 
324 aa  303  2e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  46.27 
 
 
394 aa  299  5e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  47.06 
 
 
404 aa  295  6e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  48.56 
 
 
324 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  48.26 
 
 
322 aa  275  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  63.98 
 
 
493 aa  274  1e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  43.44 
 
 
319 aa  274  2e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  42.5 
 
 
319 aa  272  5e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.5 
 
 
319 aa  272  5e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.04 
 
 
316 aa  270  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.72 
 
 
316 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  42.09 
 
 
316 aa  270  3e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.72 
 
 
316 aa  270  3e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  42.72 
 
 
316 aa  268  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.72 
 
 
316 aa  268  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.09 
 
 
316 aa  267  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.09 
 
 
316 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  43.08 
 
 
339 aa  262  5e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  57.94 
 
 
449 aa  261  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  57.48 
 
 
449 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  57.28 
 
 
460 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  57.82 
 
 
460 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  58.29 
 
 
457 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  57.01 
 
 
449 aa  259  4e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  56.54 
 
 
452 aa  259  5e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  39.94 
 
 
350 aa  258  7e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  57.35 
 
 
460 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  41.43 
 
 
352 aa  256  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  41.79 
 
 
347 aa  256  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  44.62 
 
 
327 aa  254  2e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  41.03 
 
 
353 aa  251  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  41.35 
 
 
343 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  39.24 
 
 
351 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  39.47 
 
 
349 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  38.84 
 
 
362 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  38.2 
 
 
359 aa  245  7e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  41.19 
 
 
346 aa  245  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  36.81 
 
 
384 aa  244  2e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  41.74 
 
 
329 aa  242  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  38.61 
 
 
359 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  38.84 
 
 
362 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  39.83 
 
 
347 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  40.18 
 
 
360 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  39.89 
 
 
375 aa  238  7e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  39.38 
 
 
357 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  39.32 
 
 
356 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  37.57 
 
 
369 aa  236  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  37.25 
 
 
362 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  38.2 
 
 
359 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  40.46 
 
 
360 aa  234  1e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  38.2 
 
 
359 aa  234  1e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  38.74 
 
 
363 aa  233  2e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  37.68 
 
 
352 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  38.31 
 
 
387 aa  233  4e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  36.77 
 
 
363 aa  233  4e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  37.99 
 
 
393 aa  232  7e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  40 
 
 
369 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  37.78 
 
 
395 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  37.92 
 
 
388 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  37.71 
 
 
393 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  36.29 
 
 
362 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  40.25 
 
 
334 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>