44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4489 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  84.47 
 
 
206 aa  295  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  55.25 
 
 
241 aa  207  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  48.63 
 
 
227 aa  162  2e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  48.63 
 
 
227 aa  162  2e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  48.4 
 
 
225 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  39.88 
 
 
227 aa  136  3e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  38.76 
 
 
227 aa  133  2e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  39.29 
 
 
178 aa  131  7e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  34.12 
 
 
199 aa  120  1e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  34.29 
 
 
191 aa  120  2e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  33.15 
 
 
186 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  31.71 
 
 
182 aa  113  2e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  113  2e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  33.73 
 
 
209 aa  112  4e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  30.14 
 
 
192 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  31.58 
 
 
190 aa  91.3  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  32.93 
 
 
169 aa  91.3  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  27.86 
 
 
169 aa  82.4  4e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  27.55 
 
 
167 aa  79.7  3e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  28.05 
 
 
169 aa  76.6  2e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  26.02 
 
 
167 aa  75.5  5e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  28.31 
 
 
167 aa  74.3  1e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  28.31 
 
 
204 aa  74.3  1e-12  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  24.1 
 
 
175 aa  71.2  9e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  25.84 
 
 
177 aa  70.1  2e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  28.57 
 
 
162 aa  67.4  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  28.05 
 
 
176 aa  67  2e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  27.85 
 
 
169 aa  66.6  3e-10  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  27.44 
 
 
176 aa  64.3  1e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  27.44 
 
 
176 aa  64.3  1e-09  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  25.61 
 
 
164 aa  63.5  2e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  24.48 
 
 
173 aa  62.4  5e-09  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  25.15 
 
 
175 aa  60.8  1e-08  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  25.14 
 
 
167 aa  60.1  2e-08  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  25.12 
 
 
175 aa  59.7  3e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  23.33 
 
 
182 aa  57  2e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  24.4 
 
 
165 aa  55.8  4e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  24.62 
 
 
178 aa  55.5  6e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  26.98 
 
 
168 aa  51.2  1e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0638  hypothetical protein  23.63 
 
 
192 aa  45.8  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  26.79 
 
 
312 aa  45.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0688  hypothetical protein  26.38 
 
 
167 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.629835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  37.04 
 
 
444 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>