44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4489 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4489  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  407  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4557  hypothetical protein  84.47 
 
 		 206 aa  295  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.38864  decreased coverage  0.00129383 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4507  hypothetical protein  55.25 
 
 		 241 aa  207  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3291  hypothetical protein  48.63 
 
 		 227 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3614  hypothetical protein  48.63 
 
 		 227 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3491  hypothetical protein  48.4 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.135183 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1227  hypothetical protein  39.88 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0152651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3484  hypothetical protein  38.76 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.509717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0405  hypothetical protein  39.29 
 
 		 178 aa  131  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0094  hypothetical protein  34.12 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.156875  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0402  hypothetical protein  34.29 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0924782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0242  hypothetical protein  33.15 
 
 		 186 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3627  hypothetical protein  31.71 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.2314  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2807  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0036  hypothetical protein  33.73 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0708  hypothetical protein  30.14 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1381  hypothetical protein  31.58 
 
 		 190 aa  91.3  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4170  hypothetical protein  32.93 
 
 		 169 aa  91.3  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4048  hypothetical protein  27.86 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3069  putative signal peptide protein  27.55 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3725  hypothetical protein  28.05 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0091  hypothetical protein  26.02 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0077  hypothetical protein  28.31 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0080  hypothetical protein  28.31 
 
 		 167 aa  74.3  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.44123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3345  hypothetical protein  24.1 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3314  hypothetical protein  25.84 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.467918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5420  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 162 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0854015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0042  hypothetical protein  28.05 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1364  hypothetical protein  27.85 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.743667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0051  hypothetical protein  27.44 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1383  hypothetical protein  27.44 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5961  hypothetical protein  25.61 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.796791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3373  hypothetical protein  24.48 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2504  hypothetical protein  25.15 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.941504  normal  0.567566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1101  hypothetical protein  25.14 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0267  hypothetical protein  25.12 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3015  hypothetical protein  23.33 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1697  putative signal peptide protein  24.4 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0027  hypothetical protein  24.62 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0268  hypothetical protein  26.98 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2699  hypothetical protein  26.79 
 
 		 312 aa  45.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0638  hypothetical protein  23.63 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0688  hypothetical protein  26.38 
 
 		 167 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.629835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1698  glutamine synthetase, type III  37.04 
 
 		 444 aa  41.2  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.738423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>