141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4459 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2219  formate--tetrahydrofolate ligase  65.83 
 
 		 557 aa  707    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.83616  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2864  Formate--tetrahydrofolate ligase  61.72 
 
 		 555 aa  644    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0663  formate--tetrahydrofolate ligase  66.55 
 
 		 557 aa  717    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0109  formate--tetrahydrofolate ligase  60.39 
 
 		 559 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0981  formate--tetrahydrofolate ligase  64.52 
 
 		 558 aa  694    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.911463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2254  formate-tetrahydrofolate ligase  60.18 
 
 		 557 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000171666  unclonable  0.000000224598 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2358  formate--tetrahydrofolate ligase  65.59 
 
 		 558 aa  709    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269795  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2204  formate--tetrahydrofolate ligase  66.55 
 
 		 559 aa  739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.160817  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0621  Formate--tetrahydrofolate ligase  59.68 
 
 		 557 aa  639    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.164812  normal  0.927809 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1409  formate--tetrahydrofolate ligase  57.71 
 
 		 555 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000797787  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1412  formate-tetrahydrofolate ligase  67.74 
 
 		 556 aa  745    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.749382  hitchhiker  0.00000422387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1317  formate--tetrahydrofolate ligase  65.77 
 
 		 555 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1580  formate--tetrahydrofolate ligase  65.77 
 
 		 555 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0203021 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3264  formate--tetrahydrofolate ligase  65.12 
 
 		 561 aa  720    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2399  formate-tetrahydrofolate ligase  59.29 
 
 		 556 aa  663    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0149  formate--tetrahydrofolate ligase  59.82 
 
 		 556 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2316  formate--tetrahydrofolate ligase  66.55 
 
 		 557 aa  717    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.345965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3272  formate--tetrahydrofolate ligase  67.5 
 
 		 555 aa  746    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0569  formate--tetrahydrofolate ligase  65.83 
 
 		 557 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0447  Formate--tetrahydrofolate ligase  84.59 
 
 		 557 aa  942    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.391987 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2767  formate--tetrahydrofolate ligase  64.82 
 
 		 557 aa  689    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0163716  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2355  formate--tetrahydrofolate ligase  58.27 
 
 		 569 aa  657    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2298  formate--tetrahydrofolate ligase  65.89 
 
 		 559 aa  736    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.307392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1383  formate--tetrahydrofolate ligase  61.44 
 
 		 565 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3083  formate--tetrahydrofolate ligase  68.1 
 
 		 559 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0555  formate--tetrahydrofolate ligase  59.78 
 
 		 558 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1283  formate--tetrahydrofolate ligase  65.35 
 
 		 555 aa  728    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0499733  normal  0.578688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0414  formate--tetrahydrofolate ligase  84.77 
 
 		 557 aa  943    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119816  normal  0.285646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0795  formate--tetrahydrofolate ligase  58.96 
 
 		 555 aa  645    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00613459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4072  formate--tetrahydrofolate ligase  82.97 
 
 		 557 aa  928    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3236  formate--tetrahydrofolate ligase  92.83 
 
 		 558 aa  1049    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.932652  normal  0.61785 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1275  formate--tetrahydrofolate ligase  60.5 
 
 		 560 aa  654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1654  formate--tetrahydrofolate ligase  64.52 
 
 		 555 aa  710    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0498666 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1052  formate--tetrahydrofolate ligase  57.99 
 
 		 556 aa  637    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0083  Formate-tetrahydrofolate ligase  59.82 
 
 		 556 aa  655    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.784091  normal  0.246286 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0484  Formate--tetrahydrofolate ligase  84.59 
 
 		 557 aa  939    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4459  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  100 
 
 		 558 aa  1131    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0477556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2815  formate--tetrahydrofolate ligase  68.1 
 
 		 559 aa  753    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.90071  normal  0.0134554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1712  formate--tetrahydrofolate ligase  65.18 
 
 		 558 aa  728    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1055  formate--tetrahydrofolate ligase  55.54 
 
 		 556 aa  634  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2785  formate--tetrahydrofolate ligase  55.2 
 
 		 556 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1007  formate--tetrahydrofolate ligase  55.71 
 
 		 555 aa  624  1e-178  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0866489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0837  formate--tetrahydrofolate ligase  57.42 
 
 		 556 aa  627  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.21789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0018  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  56.79 
 
 		 556 aa  626  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1593  formate--tetrahydrofolate ligase  58.09 
 
 		 583 aa  628  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211237  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24910  Formate-tetrahydrofolate ligase  59.32 
 
 		 557 aa  627  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2471  formate--tetrahydrofolate ligase  54.84 
 
 		 556 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2752  formate--tetrahydrofolate ligase  56.61 
 
 		 556 aa  621  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00362383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00600  Formate--tetrahydrofolate ligase  58.06 
 
 		 554 aa  619  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00136025  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1079  formate--tetrahydrofolate ligase  56.63 
 
 		 552 aa  619  1e-176  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000612809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0816  Formate--tetrahydrofolate ligase  59.5 
 
 		 554 aa  619  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0136585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2187  formate--tetrahydrofolate ligase  57.01 
 
 		 562 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0200027  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20990  Formate-tetrahydrofolate ligase  58.42 
 
 		 556 aa  618  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4561  formate-tetrahydrofolate ligase  59.93 
 
 		 559 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1952  formate--tetrahydrofolate ligase  56.47 
 
 		 583 aa  615  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0316175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2201  formate--tetrahydrofolate ligase  56.83 
 
 		 562 aa  615  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0045703  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2141  formate--tetrahydrofolate ligase  56.83 
 
 		 562 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3197  formate--tetrahydrofolate ligase  56.83 
 
 		 562 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.780376  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1959  formate--tetrahydrofolate ligase  56.83 
 
 		 562 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1938  formate--tetrahydrofolate ligase  56.83 
 
 		 562 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1914  formate--tetrahydrofolate ligase  56.83 
 
 		 562 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.251904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2107  formate--tetrahydrofolate ligase  56.83 
 
 		 562 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2117  formate--tetrahydrofolate ligase  56.83 
 
 		 583 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.546563  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02250  Formate-tetrahydrofolate ligase  61.36 
 
 		 555 aa  607  9.999999999999999e-173  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1295  formate--tetrahydrofolate ligase  53.6 
 
 		 555 aa  600  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.973248  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1787  formate--tetrahydrofolate ligase  54.14 
 
 		 555 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1822  formate--tetrahydrofolate ligase  54.14 
 
 		 555 aa  601  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.173797  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1009  formate-tetrahydrofolate ligase  56.29 
 
 		 560 aa  595  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.749229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2901  formate--tetrahydrofolate ligase  57.6 
 
 		 565 aa  591  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2105  Formate--tetrahydrofolate ligase  53.68 
 
 		 553 aa  588  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2125  Formate--tetrahydrofolate ligase  52.15 
 
 		 553 aa  588  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0701  formate-tetrahydrofolate ligase  55.1 
 
 		 554 aa  585  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287998  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25140  Formate-tetrahydrofolate ligase  56.22 
 
 		 557 aa  584  1.0000000000000001e-165  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.350254  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0131  formate--tetrahydrofolate ligase  53.29 
 
 		 553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0219  formate--tetrahydrofolate ligase  54.87 
 
 		 564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0304  formate--tetrahydrofolate ligase  54.22 
 
 		 551 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1058  formate--tetrahydrofolate ligase  54.68 
 
 		 542 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1111  Formate--tetrahydrofolate ligase  52.87 
 
 		 551 aa  580  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.596432  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1054  formate--tetrahydrofolate ligase  54.68 
 
 		 542 aa  579  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1756  formate--tetrahydrofolate ligase  50.99 
 
 		 554 aa  577  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0118  formate--tetrahydrofolate ligase  52.95 
 
 		 557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0451  Formate--tetrahydrofolate ligase  52.78 
 
 		 555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2610  formate--tetrahydrofolate ligase  58.17 
 
 		 558 aa  571  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00320699 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0522  formate--tetrahydrofolate ligase  53.81 
 
 		 564 aa  568  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.897337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1637  Formate--tetrahydrofolate ligase  52.29 
 
 		 544 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1321  formate--tetrahydrofolate ligase  52.15 
 
 		 555 aa  561  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0019  formate--tetrahydrofolate ligase  51.89 
 
 		 554 aa  552  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000114952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0129  formate--tetrahydrofolate ligase  52.28 
 
 		 567 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000126752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1820  Formate--tetrahydrofolate ligase  53.81 
 
 		 565 aa  554  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2057  Formate--tetrahydrofolate ligase  51.59 
 
 		 567 aa  551  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0269  Formate--tetrahydrofolate ligase  50.71 
 
 		 551 aa  550  1e-155  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0358  formate--tetrahydrofolate ligase  51.88 
 
 		 550 aa  550  1e-155  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0792424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3185  Formate--tetrahydrofolate ligase  53.58 
 
 		 560 aa  548  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0089  formate--tetrahydrofolate ligase  51.06 
 
 		 566 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.985231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2519  formate--tetrahydrofolate ligase  50.7 
 
 		 573 aa  536  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0766  formate--tetrahydrofolate ligase  50.52 
 
 		 576 aa  535  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1568  formate--tetrahydrofolate ligase  50.52 
 
 		 576 aa  534  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110911  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0769  formate-tetrahydrofolate ligase  51.16 
 
 		 553 aa  535  1e-150  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.115435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0231  Formate--tetrahydrofolate ligase  48.59 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12980  formate--tetrahydrofolate ligase  52.12 
 
 		 564 aa  527  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.700503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>