259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4429 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  92.51 
 
 		 187 aa  333  5.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  82.45 
 
 		 188 aa  315  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  82.45 
 
 		 188 aa  315  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  82.45 
 
 		 188 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  83.51 
 
 		 188 aa  294  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  68.09 
 
 		 186 aa  266  8.999999999999999e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  66.49 
 
 		 186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  67.89 
 
 		 189 aa  258  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  66.14 
 
 		 189 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  65.79 
 
 		 188 aa  256  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  65.62 
 
 		 190 aa  253  9e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  65.78 
 
 		 188 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  66.85 
 
 		 190 aa  249  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  61.38 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  64.71 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  62.63 
 
 		 188 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  62.5 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  65.1 
 
 		 190 aa  247  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  65.1 
 
 		 190 aa  247  8e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  67.04 
 
 		 188 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  63.93 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  65.56 
 
 		 188 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  62.01 
 
 		 188 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  62.03 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  65.61 
 
 		 187 aa  229  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  59.36 
 
 		 187 aa  227  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  59.89 
 
 		 186 aa  227  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  58.2 
 
 		 192 aa  222  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  60.11 
 
 		 201 aa  222  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  59.57 
 
 		 187 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  56.02 
 
 		 190 aa  218  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  59.36 
 
 		 186 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  60.43 
 
 		 186 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  57.22 
 
 		 187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  57.67 
 
 		 183 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  60.96 
 
 		 185 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  54.55 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  56.61 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  55.73 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  50.27 
 
 		 191 aa  197  9e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  51.32 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  48.66 
 
 		 206 aa  177  5.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  42.78 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  45.05 
 
 		 326 aa  168  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  44.5 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  47.59 
 
 		 186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  40.31 
 
 		 254 aa  158  4e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  43.92 
 
 		 309 aa  153  1e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  43.59 
 
 		 195 aa  146  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.94 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  40.21 
 
 		 242 aa  138  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.84 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  39.56 
 
 		 299 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  37.91 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  36.7 
 
 		 305 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.22 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.65 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.24 
 
 		 299 aa  106  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  29.89 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  28.72 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  28.35 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.94 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  41.03 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  37.23 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.74 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.74 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  38.46 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.18 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  44.29 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.32 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  43.55 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  37.84 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.33 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  35.94 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.03 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.68 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.33 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.54 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  38.57 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  41.27 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  42.37 
 
 		 72 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 74 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  41.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  40.91 
 
 		 89 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  41.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.91 
 
 		 86 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  41.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  40.32 
 
 		 72 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  41.94 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 73 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  38.46 
 
 		 81 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>