108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4336 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 1366 aa  2816    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.6 
 
 		 916 aa  503  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  33.72 
 
 		 1044 aa  298  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  43.64 
 
 		 849 aa  294  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 		 1067 aa  250  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0543  hypothetical protein  42.73 
 
 		 431 aa  221  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155137  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3231  hypothetical protein  36.6 
 
 		 423 aa  200  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.56 
 
 		 1161 aa  165  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  38.71 
 
 		 1386 aa  165  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.61 
 
 		 1162 aa  156  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 857 aa  155  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.84 
 
 		 2796 aa  139  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 		 581 aa  136  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 		 1236 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  35.96 
 
 		 872 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  33.75 
 
 		 846 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  32.54 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 		 828 aa  129  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 756 aa  127  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  26.1 
 
 		 631 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  32.48 
 
 		 2342 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  33.6 
 
 		 2342 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 		 1247 aa  119  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.28 
 
 		 666 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  24.06 
 
 		 606 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  32.74 
 
 		 751 aa  109  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  32.74 
 
 		 751 aa  110  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  38.85 
 
 		 535 aa  109  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1632 aa  108  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  33.33 
 
 		 686 aa  108  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  30.86 
 
 		 1806 aa  108  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  31.88 
 
 		 665 aa  108  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  35.43 
 
 		 521 aa  107  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  33.61 
 
 		 695 aa  102  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 		 588 aa  99  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3349  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 406 aa  97.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0542169  decreased coverage  0.00718656 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  25.2 
 
 		 513 aa  95.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  37.33 
 
 		 597 aa  95.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 1297 aa  95.1  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  30.7 
 
 		 1003 aa  94.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  41.96 
 
 		 746 aa  93.2  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  23.75 
 
 		 1313 aa  92.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  29.69 
 
 		 972 aa  92  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 		 1322 aa  91.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 		 1152 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 1152 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 987 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1351  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.83 
 
 		 326 aa  89.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.054714  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 		 361 aa  87.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 1264 aa  87  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1172  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.63 
 
 		 325 aa  86.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.535151  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 1059 aa  86.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  45.71 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  43.24 
 
 		 294 aa  85.9  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 1035 aa  85.5  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  33.55 
 
 		 518 aa  84.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  42.34 
 
 		 294 aa  84.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  42.34 
 
 		 294 aa  82.8  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 995 aa  82.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  37.8 
 
 		 305 aa  82.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.78 
 
 		 519 aa  81.6  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  40.37 
 
 		 1317 aa  81.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  34.97 
 
 		 223 aa  80.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 882 aa  79.3  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 		 361 aa  79.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  27.61 
 
 		 736 aa  78.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  34.12 
 
 		 235 aa  76.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 		 1301 aa  76.3  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  34.04 
 
 		 678 aa  75.1  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 1600 aa  74.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 1082 aa  74.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 995 aa  71.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4196  putative glycosyltransferase  23.55 
 
 		 321 aa  67.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.97214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 		 680 aa  67.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0194  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.09 
 
 		 1030 aa  65.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.478179  normal  0.202033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  42.86 
 
 		 227 aa  65.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  46.48 
 
 		 1476 aa  64.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  36.49 
 
 		 592 aa  64.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  48.15 
 
 		 399 aa  63.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2165  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 579 aa  62  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  37.78 
 
 		 115 aa  62  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  29.21 
 
 		 793 aa  61.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  29.3 
 
 		 462 aa  60.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  41.18 
 
 		 255 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  39.73 
 
 		 644 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  40.48 
 
 		 120 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  41.1 
 
 		 355 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  40.51 
 
 		 137 aa  59.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  26.72 
 
 		 823 aa  59.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  40.51 
 
 		 137 aa  58.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 1075 aa  58.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  39.24 
 
 		 137 aa  57  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  29.52 
 
 		 2296 aa  56.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4803  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 438 aa  54.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01351  hypothetical protein  25.95 
 
 		 769 aa  54.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  30 
 
 		 1880 aa  53.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.4 
 
 		 418 aa  52.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5486  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 398 aa  51.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2174  hypothetical protein  26.67 
 
 		 404 aa  49.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  36.99 
 
 		 814 aa  49.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>