214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4253 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  100 
 
 		 147 aa  290  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  82.44 
 
 		 134 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  80.92 
 
 		 139 aa  207  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  76.87 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3559  transcriptional regulator, MucR family  75.54 
 
 		 144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  75.2 
 
 		 162 aa  192  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  68.7 
 
 		 173 aa  183  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  72.18 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  66.9 
 
 		 166 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  73.68 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  70.08 
 
 		 147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  70.8 
 
 		 150 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  70.29 
 
 		 171 aa  180  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  70.08 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  73.11 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  72.03 
 
 		 133 aa  176  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  69.35 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  63.57 
 
 		 143 aa  174  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  67.72 
 
 		 144 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  67.44 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  69.84 
 
 		 162 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  67.72 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  70.25 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  68.85 
 
 		 164 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 143 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  62.14 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  69.75 
 
 		 164 aa  166  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  70.34 
 
 		 166 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  65.19 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 144 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 143 aa  163  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  63.36 
 
 		 143 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  70.08 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  66.39 
 
 		 164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  63.43 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  70.94 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  63.71 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  72.13 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 145 aa  157  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  60.84 
 
 		 166 aa  156  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  60.33 
 
 		 137 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5626  transcriptional regulator, MucR family  71.19 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.63695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3504  transcriptional regulator, MucR family  72.03 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4660  transcriptional regulator, MucR family  58.87 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20016  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4116  MucR family transcriptional regulator  67.19 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2100  transcriptional regulator, MucR family  63.24 
 
 		 166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0587  MucR family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0109398  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4157  transcriptional regulator, MucR family  60.47 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  58.91 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3912  MucR family transcriptional regulator  59.68 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.913011  normal  0.1317 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  59.17 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8284  transcriptional regulator, MucR family  60.66 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647815  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 155 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  57.46 
 
 		 145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  54.01 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  59.84 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  59.84 
 
 		 162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  60.63 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1940  MucR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00262472  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  56.92 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 156 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 140 aa  135  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  55.04 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  53.38 
 
 		 189 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 169 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  57.48 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6371  MucR family transcriptional regulator  55.28 
 
 		 137 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1517  MucR family transcriptional regulator  53.39 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400145  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0068  transcriptional regulator, MucR family  59.17 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  49.23 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  49.23 
 
 		 176 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3574  transcriptional regulator, MucR family  59.68 
 
 		 185 aa  133  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0283517  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0432  ROSMUCR transcriptional regulator  55.22 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0466  transcriptional regulator, MucR family  55.22 
 
 		 145 aa  133  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.138143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  48.89 
 
 		 177 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7826  transcriptional regulator, MucR family  55.64 
 
 		 174 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0082  transcriptional regulator, MucR family  55.65 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6025  MucR family transcriptional regulator  53.91 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6057  MucR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0170  ROSMUCR transcriptional regulator  55.28 
 
 		 186 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  53.03 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  52.31 
 
 		 137 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  54.4 
 
 		 172 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5993  MucR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0950336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4896  MucR family transcriptional regulator  55 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127609  hitchhiker  0.00352911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 137 aa  130  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2907  MucR family transcriptional regulator  53.78 
 
 		 168 aa  130  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000783071  hitchhiker  0.00150046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 138 aa  130  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  56.45 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  53.72 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>