More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4162 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  93.59 
 
 
440 aa  815    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
440 aa  867    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  72.87 
 
 
443 aa  630  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3911  protein of unknown function DUF21  71.46 
 
 
418 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2493  protein of unknown function DUF21  71.46 
 
 
404 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7616  protein of unknown function DUF21  71.22 
 
 
418 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2174  protein of unknown function DUF21  71.07 
 
 
404 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  64.08 
 
 
443 aa  555  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  64.47 
 
 
439 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  63.86 
 
 
443 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  64.34 
 
 
442 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2217  CBS domain-containing protein  70.33 
 
 
365 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332679 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  60.42 
 
 
442 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1590  hemolysins and related proteins  55.5 
 
 
436 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.727705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  36.47 
 
 
442 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  42.49 
 
 
431 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  42.93 
 
 
446 aa  305  9.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  41.09 
 
 
446 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  40.8 
 
 
439 aa  294  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  38.68 
 
 
446 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  38.5 
 
 
437 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  39.76 
 
 
436 aa  286  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  35.66 
 
 
447 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  39.95 
 
 
433 aa  276  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  37.68 
 
 
430 aa  276  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  37.24 
 
 
432 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  38.12 
 
 
438 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  37.24 
 
 
432 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  37.53 
 
 
455 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  37.91 
 
 
442 aa  270  4e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  37 
 
 
432 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  37 
 
 
432 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  37 
 
 
432 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  34.38 
 
 
434 aa  268  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  38.36 
 
 
437 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.77 
 
 
432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  37.84 
 
 
443 aa  266  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.73 
 
 
425 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  36.53 
 
 
432 aa  263  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  36.3 
 
 
441 aa  263  4e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.52 
 
 
442 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  35.9 
 
 
442 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  34.12 
 
 
437 aa  257  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  33.33 
 
 
440 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  35.25 
 
 
443 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  35.25 
 
 
443 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  34.03 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  34.03 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  34.03 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  34.03 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  34.03 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  34.03 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 
435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 
435 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  36.45 
 
 
458 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  35.66 
 
 
439 aa  252  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 
439 aa  252  8.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  35.14 
 
 
436 aa  252  9.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  35.43 
 
 
439 aa  251  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  35.8 
 
 
430 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  33.94 
 
 
446 aa  251  2e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  37.88 
 
 
432 aa  250  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  35.43 
 
 
439 aa  250  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  37.41 
 
 
434 aa  249  6e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  34.49 
 
 
433 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 
435 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  34.77 
 
 
428 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  33.88 
 
 
440 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  35.9 
 
 
456 aa  247  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  35.59 
 
 
437 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  34.51 
 
 
448 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  36.45 
 
 
442 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  34.05 
 
 
435 aa  246  8e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 
442 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  39.94 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  33.88 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  33.41 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  33.64 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  39.94 
 
 
361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  32.21 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  33.41 
 
 
440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  36.12 
 
 
453 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  36.41 
 
 
466 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  33.41 
 
 
442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  32.62 
 
 
443 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  33.41 
 
 
442 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  33.41 
 
 
442 aa  243  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  33.41 
 
 
442 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  32.62 
 
 
443 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  31.24 
 
 
439 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  32.7 
 
 
451 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  32.7 
 
 
451 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  32.7 
 
 
451 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 
435 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  37.23 
 
 
464 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  35.21 
 
 
428 aa  239  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  32.46 
 
 
443 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  35.2 
 
 
444 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  37.2 
 
 
432 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  33.57 
 
 
451 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>