More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4128 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4128  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  100 
 
 
215 aa  440  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4392  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  89.25 
 
 
215 aa  394  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165622  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2058  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  79.07 
 
 
215 aa  358  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.313982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1212  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  79.44 
 
 
219 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1017  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  81.04 
 
 
219 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1083  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  78.97 
 
 
219 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4631  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  67.68 
 
 
209 aa  295  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.247115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1024  NADH dehydrogenase subunit C  71.07 
 
 
200 aa  290  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0890  NADH dehydrogenase subunit C  68.18 
 
 
201 aa  286  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31158  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1353  NADH dehydrogenase subunit C  68.02 
 
 
200 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2422  NADH dehydrogenase subunit C  69.19 
 
 
202 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1261  NADH dehydrogenase subunit C  67.51 
 
 
200 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.841588  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1357  NADH dehydrogenase subunit C  65.66 
 
 
200 aa  276  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.357714  normal  0.0381949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3224  NADH dehydrogenase subunit C  65.99 
 
 
200 aa  276  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0405196  normal  0.943012 
 
 
-
 
NC_004310  BR0804  NADH dehydrogenase subunit C  69.04 
 
 
202 aa  274  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0799  NADH dehydrogenase subunit C  69.04 
 
 
202 aa  274  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.557773  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2920  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  66.67 
 
 
204 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2397  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  63.59 
 
 
212 aa  271  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29035  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1714  NADH dehydrogenase subunit C  64.29 
 
 
200 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0780  NADH dehydrogenase subunit C  65.66 
 
 
205 aa  269  2e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.575172  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5798  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  63.4 
 
 
205 aa  265  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323776  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2402  NADH dehydrogenase subunit C  64.25 
 
 
199 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1886  NADH dehydrogenase subunit C  63.78 
 
 
206 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.585114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4561  NADH dehydrogenase subunit C  63.92 
 
 
201 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.209035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3298  NADH dehydrogenase subunit C  63.45 
 
 
204 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2219  NADH dehydrogenase subunit C  61.73 
 
 
206 aa  257  9e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.534462  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2834  NADH dehydrogenase subunit C  61.69 
 
 
214 aa  252  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156781  normal  0.125217 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1557  NADH dehydrogenase subunit C  59.11 
 
 
213 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2885  NADH dehydrogenase subunit C  59.39 
 
 
204 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.419864  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2574  NADH dehydrogenase subunit C  60.41 
 
 
204 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0228869  normal  0.121819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2248  NADH dehydrogenase subunit C  60.71 
 
 
208 aa  245  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0117858  normal  0.111894 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1309  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  61.58 
 
 
274 aa  241  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.620386  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1309  NADH dehydrogenase subunit C  56.92 
 
 
215 aa  240  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.0849556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0743  NADH dehydrogenase subunit C  57.14 
 
 
201 aa  239  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2005  NADH dehydrogenase subunit C  56.35 
 
 
200 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2514  NADH dehydrogenase subunit C  56.85 
 
 
200 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1176  NADH dehydrogenase subunit C  56.85 
 
 
200 aa  238  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410937  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1171  NADH dehydrogenase subunit C  56.85 
 
 
207 aa  234  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3330  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  59.8 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345672  normal  0.0583392 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2301  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  57.81 
 
 
309 aa  230  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2984  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  56.06 
 
 
217 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401685  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03360  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, putative  52.63 
 
 
284 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0923  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  58.33 
 
 
213 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74163  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial precursor  47.96 
 
 
281 aa  205  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0353139  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1122  NADH dehydrogenase I, C subunit  49.44 
 
 
190 aa  191  9e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10229  NADH-ubiquinone oxidoreductase 30.4 kDa subunit, mitochondrial [Precursor] (Eurofung)  46.43 
 
 
290 aa  191  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.048814  normal  0.463288 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0788  NADH dehydrogenase I, C subunit  46.37 
 
 
192 aa  188  5e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.879269  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0287  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.93 
 
 
192 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.282798  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2255  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  52.27 
 
 
202 aa  181  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000967355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2628  NADH-quinone oxidoreductase, C subunit  52.27 
 
 
202 aa  181  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.972938  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1144  NADH dehydrogenase subunit C  51.14 
 
 
200 aa  176  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0133265  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1265  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  53.14 
 
 
202 aa  175  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1093  NADH dehydrogenase subunit C  50.28 
 
 
205 aa  175  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1030  NADH dehydrogenase subunit C  50.82 
 
 
200 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000284725  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1744  NADH dehydrogenase subunit C  51.14 
 
 
201 aa  174  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1292  NADH dehydrogenase subunit C  51.37 
 
 
200 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1132  NADH dehydrogenase subunit C  51.37 
 
 
200 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.304231  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1301  NADH dehydrogenase subunit C  51.37 
 
 
200 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1827  NADH dehydrogenase subunit C  51.37 
 
 
200 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.767422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1437  NADH dehydrogenase subunit C  51.37 
 
 
200 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0735  NADH dehydrogenase subunit C  51.37 
 
 
200 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.018373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0415  NADH dehydrogenase subunit C  51.37 
 
 
200 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3633  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.15 
 
 
187 aa  174  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2007  NADH dehydrogenase subunit C  49.43 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000228577  normal  0.372877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1063  NADH dehydrogenase subunit C  50.82 
 
 
200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1345  NADH dehydrogenase subunit C  48.86 
 
 
200 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000229518  hitchhiker  0.00575892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0963  NADH dehydrogenase subunit C  48.6 
 
 
199 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0785182  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3212  NADH dehydrogenase subunit C  48.86 
 
 
200 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2271  NADH dehydrogenase subunit C  49.18 
 
 
200 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00136652  normal  0.138518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1635  NADH dehydrogenase subunit C  49.18 
 
 
200 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00516199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2247  NADH dehydrogenase subunit C  49.18 
 
 
200 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00797265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5575  NADH dehydrogenase subunit C  48.63 
 
 
200 aa  168  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0959  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.71 
 
 
202 aa  168  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653552 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0874  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.71 
 
 
202 aa  168  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.714577  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1616  NADH dehydrogenase (ubiquinone), C subunit  45.73 
 
 
227 aa  168  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0142327  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0547  NADH-quinone oxidoreductase chain C  45.73 
 
 
227 aa  168  7e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0951  NADH dehydrogenase subunit C  48.86 
 
 
201 aa  167  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0929  NADH dehydrogenase subunit C  49.43 
 
 
199 aa  167  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00761919  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0432  NADH dehydrogenase I, C subunit  52.29 
 
 
186 aa  167  9e-41  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2285  NADH dehydrogenase subunit C  48.63 
 
 
200 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000512824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2164  NADH dehydrogenase subunit C  48.63 
 
 
200 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116898  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2060  NADH dehydrogenase subunit C  47.19 
 
 
200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.072727  normal  0.101712 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2811  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  46.15 
 
 
203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1049  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50 
 
 
199 aa  165  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0823  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  50 
 
 
199 aa  165  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1889  NADH dehydrogenase subunit C  48.88 
 
 
200 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.01317  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0819  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.37 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2212  NADH dehydrogenase subunit C  46.63 
 
 
200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.470174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1503  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.43 
 
 
199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00949077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5178  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.64 
 
 
203 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1495  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.43 
 
 
202 aa  161  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3508  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.43 
 
 
203 aa  158  5e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2059  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.45 
 
 
197 aa  158  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1405  NADH dehydrogenase (quinone)  49.46 
 
 
203 aa  158  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.820267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3254  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  49.13 
 
 
203 aa  158  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.846345  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2834  NADH dehydrogenase I chain C  43.72 
 
 
227 aa  156  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2703  NADH dehydrogenase I chain C  44.22 
 
 
227 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0988  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  44.08 
 
 
239 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1426  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  45.65 
 
 
204 aa  153  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.374971  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2563  NADH (or F420H2) dehydrogenase, subunit C  47.43 
 
 
231 aa  150  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>