142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4078 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5065  phage portal protein, HK97 family  95.4 
 
 
455 aa  889  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4078  phage portal protein, HK97 family  100 
 
 
457 aa  934  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333282  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4113  HK97 family phage portal protein  60 
 
 
455 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2611  phage portal protein, HK97 family  60.09 
 
 
454 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4284  phage portal protein, HK97 family  60.09 
 
 
454 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0243  HK97 family phage portal protein  52.7 
 
 
441 aa  473  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2236  HK97 family phage portal protein  52.55 
 
 
447 aa  469  1e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.759812  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2891  putative phage portal protein, HK97 family  53.03 
 
 
833 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  6.39413e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2245  putative phage portal protein, HK97 family  53.03 
 
 
859 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.40812e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1540  putative phage portal protein, HK97 family  53.03 
 
 
833 aa  436  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.533039 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1772  HK97 family phage portal protein  51.81 
 
 
451 aa  400  1e-110  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1630  HK97 family phage portal protein  26.71 
 
 
440 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.506997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2595  HK97 family phage portal protein  24.24 
 
 
436 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1087  HK97 family portal protein , putative  26.54 
 
 
444 aa  125  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2836  phage portal protein, HK97 family  26.3 
 
 
414 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0398  HK97 family phage portal protein  26.06 
 
 
414 aa  124  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1602  phage portal protein, HK97 family  26.87 
 
 
434 aa  122  1e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1252  HK97 family phage portal protein  26.04 
 
 
420 aa  120  4e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2269  phage portal protein, HK97 family  26.65 
 
 
413 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.75865e-11 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0862  phage portal protein, HK97 family  22.95 
 
 
389 aa  120  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.55494e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2273  phage portal protein, HK97 family  26.7 
 
 
425 aa  120  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1313  phage portal protein, HK97 family  26.7 
 
 
425 aa  120  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1697  phage portal protein, HK97 family  26.7 
 
 
425 aa  120  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1188  HK97 family phage portal protein  26.65 
 
 
413 aa  119  1e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  1.36411e-08 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3879  HK97 family phage portal protein  26.5 
 
 
423 aa  118  2e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49861  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2265  phage portal protein, HK97 family  26.42 
 
 
413 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0612775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1680  HK97 family phage portal protein  28.61 
 
 
416 aa  115  2e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.905165  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1670  Phage portal protein, HK97  27.7 
 
 
407 aa  115  2e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5152  HK97 family phage portal protein  25.6 
 
 
412 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1469  HK97 family portal protein  21.74 
 
 
390 aa  114  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1483  hypothetical protein  24.26 
 
 
421 aa  113  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1586  HK97 family phage portal protein  25.33 
 
 
415 aa  113  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00170734  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4463  phage portal protein, HK97 family  25.19 
 
 
434 aa  112  1e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  6.79414e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7331  phage portal protein, HK97 family  27.79 
 
 
428 aa  112  1e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3396  HK97 family phage portal protein  23.94 
 
 
445 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0697474  hitchhiker  6.93474e-09 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1565  HK97 family phage portal protein  26.09 
 
 
431 aa  110  4e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  6.49364e-05 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1356  HK97 family phage portal protein  30.77 
 
 
393 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.423386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1337  HK97 family phage portal protein  26.09 
 
 
444 aa  110  7e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0647  Phage portal protein, HK97  26.88 
 
 
434 aa  110  7e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.239357  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7142  HK97 family phage portal protein  24.75 
 
 
524 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.994183  hitchhiker  0.00715135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1617  HK97 family phage portal protein  26.22 
 
 
426 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.709388  normal  0.287703 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0013  HK97 family phage portal protein  26.27 
 
 
393 aa  109  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5463  hypothetical protein  26.55 
 
 
412 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0014  phage portal protein, HK97 family  25.83 
 
 
409 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4251  phage portal protein, HK97 family  25.07 
 
 
544 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0274  HK97 family phage portal protein  28.83 
 
 
392 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0463  phage portal protein  24.34 
 
 
411 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.390433 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0033  HK97 family phage portal protein  25.56 
 
 
393 aa  103  5e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.13061  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2600  HK97 family phage portal protein  24.59 
 
 
408 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1286  HK97 family phage portal protein  26.32 
 
 
384 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3316  HK97 family phage portal protein  24.42 
 
 
416 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.246565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2069  HK97 family phage portal protein  24.42 
 
 
416 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0858  phage lambdaBa02, DNA replication protein  25.45 
 
 
408 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1544  Phage portal protein, HK97  27.02 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1012  HK97 family phage portal protein  25.21 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.982443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1657  phage portal protein, HK97 family  26.25 
 
 
408 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4979  hypothetical protein  24.16 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5358  hypothetical protein  24.16 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4004  phage portal protein, HK97 family  22.63 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0869  HK97 family phage portal protein  26.04 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2594  phage portal protein, HK97 family  27.72 
 
 
434 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.601506  normal  0.257209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0644  HK97 family phage portal protein  23.97 
 
 
401 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3972  HK97 family phage portal protein  25.46 
 
 
411 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1682  phage phi-105 ORF25-like protein  22.88 
 
 
407 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.844077 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2965  prophage LambdaSo, HK97 family portal protein  25.78 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0555  phage portal protein, HK97 family  24.65 
 
 
448 aa  90.5  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0158159  hitchhiker  0.0015106 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1336  HK97 family phage portal protein  25.27 
 
 
417 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.352989  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1485  Phage portal protein, HK97  26.99 
 
 
399 aa  90.1  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.334021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1721  HK97 family phage portal protein  23.75 
 
 
419 aa  88.2  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0339  Phage portal protein, HK97  24.72 
 
 
407 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0482575  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3945  HK97 family phage portal protein  22.87 
 
 
404 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00231416  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0953  HK97 family phage portal protein  23.4 
 
 
404 aa  87  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1717  Phage portal protein, HK97  24.58 
 
 
406 aa  86.3  1e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2027  phage portal protein  23.68 
 
 
406 aa  85.5  2e-15  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1624  Phage portal protein, HK97  22.82 
 
 
428 aa  84.7  3e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0210145  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1628  Phage portal protein, HK97  25.22 
 
 
392 aa  83.6  6e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.220321  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2360  head HK97 family portal protein  23.96 
 
 
397 aa  83.6  7e-15  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1751  HK97 family phage portal protein  25.32 
 
 
420 aa  82.8  1e-14  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.518591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3489  Phage portal protein, HK97  26.4 
 
 
391 aa  82.8  1e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3975  phage portal protein, HK97 family  26.7 
 
 
398 aa  82  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3314  phage portal protein, HK97 family  24.92 
 
 
433 aa  82  2e-14  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.6128e-12 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2622  phage portal protein, HK97 family  23.95 
 
 
417 aa  81.3  3e-14  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.830928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2092  phage portal protein, HK97 family  26.35 
 
 
391 aa  81.3  3e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1801  Phage portal protein, HK97  28.01 
 
 
391 aa  80.5  7e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.595196  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0989  HK97 family phage portal protein  23.2 
 
 
445 aa  79.3  1e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1898  HK97 family phage portal protein  25.28 
 
 
416 aa  79  2e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0360  HK97 family phage portal protein  23.2 
 
 
445 aa  78.6  2e-13  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2492  Phage portal protein, HK97  27.4 
 
 
395 aa  79  2e-13  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0671  HK97 family phage portal protein  22.91 
 
 
372 aa  77.8  4e-13  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0625  phage portal protein, HK97 family  20.39 
 
 
413 aa  77.4  5e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1966  Phage portal protein, HK97  26.82 
 
 
391 aa  75.9  1e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1161  Phage portal protein, HK97  26.4 
 
 
391 aa  75.9  2e-12  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.255409  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1457  phage portal protein, HK97 family  22.16 
 
 
417 aa  75.5  2e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6184  portal protein  26.11 
 
 
414 aa  74.7  3e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1410  Phage portal protein, HK97  28.07 
 
 
391 aa  74.3  4e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1058  Phage portal protein, HK97  26.36 
 
 
401 aa  73.9  5e-12  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0489201 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2468  putative portal protein  25.64 
 
 
391 aa  71.2  3e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2901  HK97 family phage portal protein  26.8 
 
 
400 aa  70.5  6e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149993  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1130  HK97 family phage portal protein  25.27 
 
 
390 aa  70.5  7e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.868122  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1996  phage portal protein, HK97 family  23.38 
 
 
473 aa  68.6  2e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>