69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4057 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  84.24 
 
 		 3521 aa  2521    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  67.82 
 
 		 3238 aa  2533    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 2900 aa  5813    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  96.28 
 
 		 2899 aa  5543    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  60.91 
 
 		 3286 aa  3024    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  75.52 
 
 		 3006 aa  4308    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  72.53 
 
 		 2140 aa  3133    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6221  hypothetical protein  58.87 
 
 		 729 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3248  hypothetical protein  81.9 
 
 		 425 aa  512  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1100 aa  485  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  37.8 
 
 		 1051 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  37.1 
 
 		 1543 aa  466  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  37.98 
 
 		 1101 aa  461  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  38.12 
 
 		 1092 aa  460  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  37.38 
 
 		 1133 aa  457  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  35.86 
 
 		 1219 aa  423  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  36 
 
 		 1221 aa  424  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  36.8 
 
 		 1103 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  34.07 
 
 		 1341 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  33.57 
 
 		 1067 aa  405  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  33.24 
 
 		 1816 aa  407  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  33.94 
 
 		 1061 aa  403  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  36.67 
 
 		 1120 aa  403  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  39.01 
 
 		 1120 aa  398  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  35.78 
 
 		 1137 aa  393  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  33.57 
 
 		 1188 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  35.41 
 
 		 1159 aa  394  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1159 aa  391  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1132 aa  389  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  32.44 
 
 		 1057 aa  390  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  35.6 
 
 		 1132 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  35.6 
 
 		 1132 aa  389  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  36.33 
 
 		 1158 aa  386  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  36.33 
 
 		 1158 aa  386  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  34.79 
 
 		 1116 aa  387  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  34.65 
 
 		 1116 aa  384  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  36.24 
 
 		 1157 aa  383  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  35.83 
 
 		 1159 aa  376  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1157 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  35.56 
 
 		 1157 aa  374  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  33.16 
 
 		 1194 aa  374  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1159 aa  373  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  31.68 
 
 		 2007 aa  354  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  38.64 
 
 		 522 aa  334  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  31.48 
 
 		 1059 aa  330  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  36.46 
 
 		 1012 aa  324  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3247  hypothetical protein  61.72 
 
 		 287 aa  305  9e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  34.45 
 
 		 881 aa  225  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  37.85 
 
 		 951 aa  196  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  33.25 
 
 		 837 aa  164  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  25.84 
 
 		 960 aa  145  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  25.31 
 
 		 2196 aa  134  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  26.14 
 
 		 1564 aa  132  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  30.91 
 
 		 1115 aa  79.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  22.82 
 
 		 1644 aa  78.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  23.29 
 
 		 918 aa  71.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3558  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1172 aa  65.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  30.39 
 
 		 1171 aa  61.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1851  hypothetical protein  28.87 
 
 		 270 aa  58.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459823  normal  0.905068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  31.61 
 
 		 702 aa  58.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  34.35 
 
 		 771 aa  57  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3893  hypothetical protein  36.05 
 
 		 762 aa  50.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1270  hypothetical protein  36.05 
 
 		 762 aa  50.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1850  hypothetical protein  27.04 
 
 		 417 aa  48.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  25.84 
 
 		 454 aa  48.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3601  fibronectin, type III domain-containing protein  31.54 
 
 		 694 aa  47  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  34.18 
 
 		 1351 aa  46.6  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0064  hypothetical protein  32.71 
 
 		 763 aa  46.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00226293  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5439  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1172 aa  46.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.861943  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>