More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3758 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  80.49 
 
 		 247 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.98 
 
 		 246 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.16 
 
 		 246 aa  309  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.57 
 
 		 246 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.33 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.32 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 225 aa  288  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.93 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  55.93 
 
 		 244 aa  285  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.72 
 
 		 384 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  49.35 
 
 		 255 aa  226  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.86 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  48.29 
 
 		 376 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.7 
 
 		 268 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.57 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.12 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 236 aa  214  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.19 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.13 
 
 		 248 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.02 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  45.22 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.22 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.42 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  42.42 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.42 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  43.21 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.85 
 
 		 244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.17 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  42.86 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.68 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  41.74 
 
 		 317 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.72 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.55 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.35 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  41.06 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.53 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  37.39 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.31 
 
 		 243 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  38.1 
 
 		 263 aa  161  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  41.13 
 
 		 281 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.96 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.74 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  34.93 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  39.04 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.76 
 
 		 250 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  36.41 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.27 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.18 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.02 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  32.58 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 252 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.76 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  34.97 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.2 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  34.46 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5658  cyclic nucleotide-binding protein  32 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.11 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  31.86 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  28.37 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  28.96 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0394  cyclic nucleotide-binding protein  26.74 
 
 		 236 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0638348  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>