More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3750 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  100 
 
 		 603 aa  1192    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  56.44 
 
 		 616 aa  671    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  75.39 
 
 		 609 aa  853    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4441  ABC transporter related  34.27 
 
 		 603 aa  307  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  35.63 
 
 		 823 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  36.11 
 
 		 823 aa  271  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3368  ABC transporter related  33.16 
 
 		 593 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3769  ABC transporter related  32.61 
 
 		 593 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  36.72 
 
 		 827 aa  260  6e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6491  ABC transporter related  34.2 
 
 		 608 aa  259  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.133272  normal  0.2359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4055  ABC transporter related  30.71 
 
 		 663 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6585  inner-membrane translocator  32.84 
 
 		 611 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3369  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 594 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2942  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 594 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3001  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 594 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1601  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 594 aa  250  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0192  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 594 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0833757  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2964  ABC transporter related  32.95 
 
 		 594 aa  250  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4058  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 594 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3984  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 		 594 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  33.51 
 
 		 598 aa  249  7e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0091  ABC transporter related  32.95 
 
 		 594 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0108  ABC transporter related  32.99 
 
 		 594 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1326  ABC transporter-like protein  33.88 
 
 		 590 aa  249  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.051365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  31.21 
 
 		 589 aa  248  3e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0091  ABC transporter related  32.64 
 
 		 594 aa  246  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  36.5 
 
 		 610 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3273  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.99 
 
 		 594 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.841496  normal  0.164323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3519  ABC transporter related  30.91 
 
 		 643 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0092  ABC transporter related  32.82 
 
 		 594 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.500773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0082  ABC transporter related  32.64 
 
 		 594 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.999385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3322  branched-chain amino acid ABC tranpsorter, permease/ATP-binding protein  32.24 
 
 		 594 aa  243  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1836  ABC transporter related  30.4 
 
 		 648 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0483035  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  34.47 
 
 		 822 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  32.12 
 
 		 830 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3907  ABC transporter related  32.72 
 
 		 594 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  30.66 
 
 		 660 aa  240  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3041  ABC transporter related  33.16 
 
 		 594 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5601  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 563 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0026  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.44 
 
 		 594 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4062  ABC transporter related  32.61 
 
 		 606 aa  236  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  32.38 
 
 		 832 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  31.11 
 
 		 593 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0384  ABC transporter related  32.17 
 
 		 614 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  30.98 
 
 		 951 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1864  ABC transporter related  32.28 
 
 		 599 aa  233  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0989  ABC transporter-related protein  32.22 
 
 		 593 aa  232  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  31.76 
 
 		 852 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1820  ABC transporter related  30.99 
 
 		 599 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  31.6 
 
 		 950 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50.85 
 
 		 248 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6016  ABC transporter related  31.63 
 
 		 611 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.604136  decreased coverage  0.00266342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  47.28 
 
 		 245 aa  228  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1796  ABC transporter related  31.42 
 
 		 679 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  33.78 
 
 		 828 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  32.31 
 
 		 612 aa  227  5.0000000000000005e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  32.87 
 
 		 608 aa  226  9e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1162  ABC transporter related  30.93 
 
 		 678 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0982828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  45.57 
 
 		 241 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1994  ABC transporter related  32.19 
 
 		 590 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0913  ABC transporter related  29.25 
 
 		 646 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0574  ABC transporter related  32.94 
 
 		 630 aa  223  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.305546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0610  ABC transporter related  30.17 
 
 		 647 aa  222  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3572  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  32.02 
 
 		 589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  52.74 
 
 		 247 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7086  ABC tranpsorter, permease protein / ATP-binding protein  33.21 
 
 		 589 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.610004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3248  branched chain amino acid ABC tranpsorter permease/ATP-binding protein  30.31 
 
 		 589 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.425684 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1684  ABC transporter related  28.39 
 
 		 629 aa  220  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0459583  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0357  ABC transporter related  28.97 
 
 		 643 aa  219  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4103  ABC transporter related  30.17 
 
 		 582 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  50.63 
 
 		 253 aa  219  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.06 
 
 		 646 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.400523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  32.42 
 
 		 631 aa  218  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  32.87 
 
 		 840 aa  217  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0897  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 357 aa  217  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  50.42 
 
 		 253 aa  217  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3511  ABC transporter-related protein  32.17 
 
 		 617 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0950055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  45.49 
 
 		 245 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2128  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 344 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1697  ABC transporter-related protein  29.6 
 
 		 652 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1663  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 326 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  46.72 
 
 		 243 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.48 
 
 		 239 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  31.26 
 
 		 954 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1100  inner-membrane translocator  36.66 
 
 		 343 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0111942  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4525  ABC transporter related  31.45 
 
 		 608 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0349155  normal  0.794169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4657  ABC transporter related  31.45 
 
 		 608 aa  213  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 		 239 aa  212  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1768  ABC transporter related  29.44 
 
 		 652 aa  212  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.412398  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3618  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 328 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466346  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  47.48 
 
 		 239 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  47.48 
 
 		 239 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  31.97 
 
 		 840 aa  211  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  48.97 
 
 		 253 aa  210  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0478  ABC transporter related  30.14 
 
 		 634 aa  210  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0802  ABC transporter related  31.65 
 
 		 588 aa  210  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4632  ABC transporter ATPase component  31.55 
 
 		 590 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  43.44 
 
 		 249 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1519  ABC transporter related  31.84 
 
 		 597 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1849  inner-membrane translocator  37.25 
 
 		 328 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.200349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>