More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3749 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  100 
 
 		 295 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  75.51 
 
 		 294 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  75.17 
 
 		 294 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  60.35 
 
 		 290 aa  345  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  43.01 
 
 		 290 aa  229  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  42.51 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  41.11 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 288 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  39.51 
 
 		 288 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  39.16 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  40.48 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 287 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  38.33 
 
 		 287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 292 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  40.28 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  38.89 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.37 
 
 		 288 aa  178  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 292 aa  176  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 308 aa  175  7e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  41.46 
 
 		 325 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.81 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.93 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  40.41 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  36.03 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  35.84 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  39.51 
 
 		 289 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  36.96 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  42.15 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.32 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.29 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 289 aa  155  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 292 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 319 aa  155  8e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0142  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 288 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  34.86 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2166  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2918  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  37.24 
 
 		 290 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.01 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3399  inner-membrane translocator  36.83 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.78 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1139  inner-membrane translocator  33.8 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 301 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3239  urea ABC transporter, permease protein UrtB  35.29 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00145341  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  33.45 
 
 		 292 aa  146  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.84 
 
 		 603 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 302 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 338 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 603 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2777  urea ABC transporter, permease protein UrtB  33.67 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 603 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3057  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.299271  normal  0.394011 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 291 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 603 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  34.71 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.49 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  34.3 
 
 		 297 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 603 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>