More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3399 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0999  hypothetical protein  58.62 
 
 		 615 aa  647    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0267446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4000  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  81.34 
 
 		 632 aa  931    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.427516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4040  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  81.66 
 
 		 633 aa  977    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206546  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2479  hypothetical protein  80.86 
 
 		 631 aa  947    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3399  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 		 629 aa  1247    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.58436  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3745  hypothetical protein  81.5 
 
 		 633 aa  971    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0847485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71280  putative ferredoxin  55.18 
 
 		 653 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.960702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0494  hypothetical protein  54.52 
 
 		 653 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6186  putative ferredoxin  54.59 
 
 		 658 aa  598  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4016  iron-sulfur cluster-binding protein  49.53 
 
 		 661 aa  588  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4781  4Fe-4S ferredoxin  53.11 
 
 		 654 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.193508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5222  hypothetical protein  53.23 
 
 		 649 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064431  hitchhiker  0.00288183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0397  iron-sulfur cluster-binding protein  53.11 
 
 		 669 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1581  hypothetical protein  52.65 
 
 		 637 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5067  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  52.18 
 
 		 637 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.010013 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3299  hypothetical protein  53.09 
 
 		 639 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2723  hypothetical protein  50.24 
 
 		 641 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4896  hypothetical protein  51.03 
 
 		 650 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395203  normal  0.74481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0311  iron-sulfur cluster-binding protein  50.87 
 
 		 650 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0857951  hitchhiker  0.00322201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0332  hypothetical protein  50.87 
 
 		 650 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0251968  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0991  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  53.87 
 
 		 670 aa  559  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.996446  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0334  hypothetical protein  51.36 
 
 		 650 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0384871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4818  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  50.31 
 
 		 641 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162779  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5204  hypothetical protein  50.69 
 
 		 641 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0575  hypothetical protein  50.69 
 
 		 641 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1864  iron-sulfur cluster binding protein  51.48 
 
 		 641 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3287  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  50.23 
 
 		 641 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5081  hypothetical protein  50.23 
 
 		 641 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.615505  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0475  iron-sulfur cluster binding protein  52.09 
 
 		 641 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.654779  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2111  iron-sulfur cluster binding protein  52.09 
 
 		 641 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5018  hypothetical protein  49.85 
 
 		 641 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646307  normal  0.216934 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4493  hypothetical protein  49.85 
 
 		 641 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1975  iron-sulfur cluster binding protein  52.09 
 
 		 641 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0706  iron-sulfur cluster binding protein  52.09 
 
 		 641 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1002  iron-sulfur cluster binding protein  52.09 
 
 		 641 aa  548  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0832  ptuative iron-sulfur cluster-binding protein  52.09 
 
 		 641 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0744  ptuative iron-sulfur cluster-binding protein  51.94 
 
 		 641 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3550  hypothetical protein  49.92 
 
 		 641 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02034  hypothetical protein  49.46 
 
 		 641 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4054  hypothetical protein  52.41 
 
 		 632 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363818  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4457  hypothetical protein  35.72 
 
 		 730 aa  361  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458302  normal  0.390978 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0809  hypothetical protein  36.17 
 
 		 727 aa  361  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0335326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2621  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.97 
 
 		 713 aa  350  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4458  hypothetical protein  34.13 
 
 		 752 aa  330  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000771252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0195  putative iron-sulphur-binding reductase  40.28 
 
 		 716 aa  316  9e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0054  hypothetical protein  34.37 
 
 		 732 aa  310  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0451564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0059  hypothetical protein  38.64 
 
 		 718 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.149051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4404  hypothetical protein  41.24 
 
 		 1033 aa  306  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326408  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26190  Fe-S oxidoreductase  39.83 
 
 		 1388 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1856  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.63 
 
 		 686 aa  304  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3646  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.49 
 
 		 694 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.37 
 
 		 694 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0242  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.07 
 
 		 717 aa  301  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3407  hypothetical protein  38.72 
 
 		 699 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.78 
 
 		 722 aa  296  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.910394  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5473  CoB--CoM heterodisulfide reductase  38.3 
 
 		 737 aa  296  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9137  hypothetical protein  36.82 
 
 		 716 aa  296  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2860  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.39 
 
 		 699 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2474  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.71 
 
 		 721 aa  294  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38640  Fe-S oxidoreductase  39.61 
 
 		 762 aa  293  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0071  hypothetical protein  42.18 
 
 		 727 aa  290  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0278  hypothetical protein  37.15 
 
 		 1044 aa  285  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0261  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.42 
 
 		 748 aa  283  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  0.510874 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1777  hypothetical protein  35.21 
 
 		 678 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4350  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  34.24 
 
 		 743 aa  282  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0207  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.12 
 
 		 774 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.987392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0619  hypothetical protein  37.26 
 
 		 1027 aa  282  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321206  normal  0.108108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4809  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.29 
 
 		 762 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0238  hypothetical protein  37.26 
 
 		 739 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855121  normal  0.712535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3454  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  33.61 
 
 		 698 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5194  ferredoxin, 4Fe-4S  35.03 
 
 		 703 aa  280  7e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0190376  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5590  ferredoxin, 4Fe-4S  35.03 
 
 		 703 aa  280  7e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0008  hypothetical protein  39.55 
 
 		 711 aa  279  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3345  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.36 
 
 		 699 aa  279  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000110964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5045  ferredoxin, 4Fe-4S  35.03 
 
 		 703 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.047294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5438  ferredoxin, 4Fe-4S  35.03 
 
 		 703 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0164712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5476  ferredoxin, 4Fe-4S  35.03 
 
 		 703 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1700  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.58 
 
 		 683 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.102017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5523  ferredoxin, 4Fe-4S  35.03 
 
 		 703 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0465  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.74 
 
 		 1131 aa  278  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.79 
 
 		 758 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5468  ferredoxin, 4Fe-4S  35.03 
 
 		 703 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000379951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5029  ferredoxin, 4Fe-4S  34.76 
 
 		 703 aa  278  3e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10343  iron-sulfur-binding reductase  38.18 
 
 		 882 aa  277  4e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.557854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5484  ferredoxin, 4Fe-4S  35.03 
 
 		 629 aa  277  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00120718  hitchhiker  1.1586099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.32 
 
 		 711 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0008  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.62 
 
 		 711 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.787604  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0429  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1042 aa  276  8e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.811487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0442  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  36.9 
 
 		 1046 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0452  hypothetical protein  36.9 
 
 		 1046 aa  276  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.506631  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4337  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.35 
 
 		 1215 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5143  hypothetical protein  34.83 
 
 		 703 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2113  hypothetical protein  36.93 
 
 		 683 aa  274  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.177792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3866  hypothetical protein  34.82 
 
 		 703 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00245399  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5262  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.5 
 
 		 737 aa  273  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2426  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.68 
 
 		 679 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0051  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.51 
 
 		 676 aa  269  1e-70  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0918  hypothetical protein  38.15 
 
 		 720 aa  266  7e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.534839 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5959  hypothetical protein  37.25 
 
 		 720 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0717248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0874  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  35.39 
 
 		 989 aa  263  8.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  normal  0.996162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>