More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3334 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3334  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 324 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4322  alcohol dehydrogenase  89.2 
 
 		 324 aa  569  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  75.47 
 
 		 326 aa  488  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  73.91 
 
 		 326 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  74.22 
 
 		 326 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3534  alcohol dehydrogenase  67.59 
 
 		 323 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  54.32 
 
 		 324 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.63 
 
 		 324 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  54.32 
 
 		 324 aa  358  8e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.4 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0037  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.09 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  58.07 
 
 		 326 aa  348  1e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 		 325 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  54.66 
 
 		 325 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  54.66 
 
 		 325 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  54.32 
 
 		 325 aa  335  7.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  53.09 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.63 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  53.09 
 
 		 326 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  52.17 
 
 		 325 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.8 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  52.94 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  52.94 
 
 		 325 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1203  oxidoreductase protein  52.16 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.47 
 
 		 324 aa  315  5e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1382  alcohol dehydrogenase  52.71 
 
 		 334 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1047  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 		 324 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.510115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1139  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.93 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0470349  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 		 361 aa  308  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1174  alcohol dehydrogenase  48.64 
 
 		 333 aa  301  7.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.755357  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2132  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.7 
 
 		 331 aa  296  3e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0861  zinc-binding alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 		 326 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1342  alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 		 326 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1259  alcohol dehydrogenase  51.85 
 
 		 326 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1960  alcohol dehydrogenase  51.85 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.480335 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.01 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1234  alcohol dehydrogenase  51.54 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0958  alcohol dehydrogenase  50.93 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1321  alcohol dehydrogenase  51.85 
 
 		 326 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  50 
 
 		 324 aa  288  8e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4474  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  51.85 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2580  alcohol dehydrogenase  46.58 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277094 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5914  alcohol dehydrogenase  47.89 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.96705  decreased coverage  0.00164429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  49.07 
 
 		 324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.46 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  48.76 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4830  alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2114  alcohol dehydrogenase  50.62 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1413  alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2783  zinc-binding alcohol dehydrogenase  44.72 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.52 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1906  alcohol dehydrogenase  49.09 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.466553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.34 
 
 		 324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.289153  normal  0.484906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0091  alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 		 324 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  44.75 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1231  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.27 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.727575  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1079  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  45.34 
 
 		 324 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.738268  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.25 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1159  alcohol dehydrogenase  45.03 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0429235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0095  alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  43.83 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2406  alcohol dehydrogenase  45.82 
 
 		 326 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2449  alcohol dehydrogenase  48.93 
 
 		 322 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1910  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.42 
 
 		 324 aa  235  8e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3749  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1251  NADPH quinone oxidoreductase, putative  46.27 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158811  normal  0.0547149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3287  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.62 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3810  alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.272499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3737  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 		 325 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.392288  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5030  alcohol dehydrogenase  45.65 
 
 		 326 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5263  putative oxidoreductase  45.79 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.333673  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3207  alcohol dehydrogenase  45.2 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2947  zinc-binding alcohol dehydrogenase  40.72 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.654698  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0674  alcohol dehydrogenase  45.71 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  decreased coverage  0.00401474 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.83 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1389  alcohol dehydrogenase  49.16 
 
 		 322 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0539  alcohol dehydrogenase  45.68 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  42.58 
 
 		 323 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1891  Zinc-binding dehydrogenase  45.37 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1716  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.31 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  42.41 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4568  alcohol dehydrogenase  45.51 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.415318  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2478  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.65 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.46705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2796  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  42.77 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.650426  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2248  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.65 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.711128  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3398  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.25 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197357  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0644  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.815744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  41.72 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4910  alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0858  zinc-binding alcohol dehydrogenase  41.3 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.08 
 
 		 327 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6127  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.27 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0714054 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0101  alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0992812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0092  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4894  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  43.52 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0082  alcohol dehydrogenase  42.46 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4202  alcohol dehydrogenase  47.2 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944165 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0360  putative oxidoreductase  40.37 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1864  alcohol dehydrogenase  40.43 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.15133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>