More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3221 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  100 
 
 
457 aa  900  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  62.08 
 
 
468 aa  511  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  43.33 
 
 
446 aa  321  2e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  39.24 
 
 
464 aa  288  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  36.83 
 
 
452 aa  270  6e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  38.25 
 
 
439 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  36.6 
 
 
452 aa  267  3e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  36.36 
 
 
452 aa  266  6e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  35.9 
 
 
453 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  38.48 
 
 
441 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  39.08 
 
 
442 aa  253  5e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  37.68 
 
 
442 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  34.52 
 
 
445 aa  248  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
460 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  37.83 
 
 
443 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  34.63 
 
 
457 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  33.97 
 
 
438 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  36.13 
 
 
445 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  39.1 
 
 
442 aa  239  7e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  37.39 
 
 
445 aa  239  8e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  37.16 
 
 
445 aa  239  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  37.16 
 
 
445 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  37.16 
 
 
445 aa  239  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.89575e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  37.16 
 
 
445 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  37.16 
 
 
445 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 
469 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  34.04 
 
 
452 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  34.49 
 
 
480 aa  234  2e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  33.7 
 
 
458 aa  229  9e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  34.35 
 
 
443 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  34.11 
 
 
443 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  34.11 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  34.11 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  34.11 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  34.11 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  34.11 
 
 
443 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  33.72 
 
 
468 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  33.72 
 
 
468 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  33.72 
 
 
468 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  33.72 
 
 
468 aa  223  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  33.72 
 
 
468 aa  223  5e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
423 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  27.8 
 
 
447 aa  166  9e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  1.4456e-12 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  28.92 
 
 
434 aa  164  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  30.68 
 
 
427 aa  162  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  26.8 
 
 
476 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  29.93 
 
 
459 aa  160  4e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
451 aa  154  3e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  30.69 
 
 
455 aa  149  1e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  28.86 
 
 
471 aa  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.47 
 
 
455 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.79 
 
 
474 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  28.77 
 
 
467 aa  140  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  29.1 
 
 
492 aa  140  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
472 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.79 
 
 
474 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.72 
 
 
457 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  29.75 
 
 
441 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.37 
 
 
474 aa  136  7e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
477 aa  136  1e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.24 
 
 
472 aa  135  1e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  27.52 
 
 
471 aa  135  2e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  28.57 
 
 
463 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
451 aa  133  8e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.77 
 
 
473 aa  132  2e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  27.43 
 
 
499 aa  131  2e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
474 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
459 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.97 
 
 
476 aa  130  5e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  27.45 
 
 
469 aa  130  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  27.13 
 
 
471 aa  129  1e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  7.49242e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
508 aa  129  1e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.62 
 
 
478 aa  129  1e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.62 
 
 
478 aa  129  1e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  26.63 
 
 
477 aa  128  2e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.23 
 
 
459 aa  128  2e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.4 
 
 
478 aa  128  2e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.4 
 
 
478 aa  128  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.4 
 
 
478 aa  128  2e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.4 
 
 
478 aa  128  2e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.4 
 
 
478 aa  128  2e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  27 
 
 
443 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  27 
 
 
441 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  28 
 
 
459 aa  127  5e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  27.73 
 
 
458 aa  126  8e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  9.61132e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
465 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  28.83 
 
 
469 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  29.95 
 
 
465 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  27.49 
 
 
472 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
451 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  29.84 
 
 
490 aa  124  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  27.59 
 
 
480 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  29.37 
 
 
496 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.48 
 
 
460 aa  123  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  28.04 
 
 
443 aa  123  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  27.74 
 
 
474 aa  123  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  26.18 
 
 
480 aa  122  1e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  28.57 
 
 
444 aa  121  2e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  28.77 
 
 
438 aa  121  2e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>