More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3115 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4697  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  89.5 
 
 
692 aa  1188    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599265  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3115  Hydantoinase/oxoprolinase  100 
 
 
686 aa  1345    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  63.72 
 
 
680 aa  848    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.49 
 
 
683 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.41 
 
 
687 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3515  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.3 
 
 
694 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.47 
 
 
694 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.15 
 
 
694 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4085  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.03 
 
 
706 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  39.97 
 
 
676 aa  450  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.93 
 
 
663 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0475  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.87 
 
 
680 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.13 
 
 
658 aa  446  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6272  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.65 
 
 
687 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.106273 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5632  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.2 
 
 
698 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0796839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1559  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.57 
 
 
680 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63787  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.51 
 
 
694 aa  436  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  38.01 
 
 
681 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1519  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.5 
 
 
690 aa  432  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.3 
 
 
765 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2209  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.76 
 
 
690 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.454656  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4408  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.66 
 
 
711 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.82 
 
 
682 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  39.65 
 
 
680 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0498  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.88 
 
 
704 aa  424  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530751  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2447  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.05 
 
 
683 aa  420  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0790  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.56 
 
 
679 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.745628 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0377  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.86 
 
 
676 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3765  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.58 
 
 
690 aa  414  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.32896  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1245  Hydantoinase/oxoprolinase  41.86 
 
 
679 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.82 
 
 
676 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2299  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.09 
 
 
694 aa  412  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375878  normal  0.208319 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.11 
 
 
701 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2083  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.01 
 
 
712 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359641  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4581  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.01 
 
 
690 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5622  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.87 
 
 
706 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.49803 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4353  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.86 
 
 
692 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4925  Hydantoin utilization protein A  39.77 
 
 
694 aa  402  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.153977 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3957  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.65 
 
 
674 aa  401  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.47 
 
 
691 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5988  N-methylhydantoinase A (Hydantoin utilization protein A)  38.73 
 
 
685 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553202  normal  0.148202 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3664  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.37 
 
 
691 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00438442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0803  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.87 
 
 
684 aa  402  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5220  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.59 
 
 
680 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.46382  normal  0.858688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.27 
 
 
676 aa  398  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4826  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.52 
 
 
831 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3811  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.87 
 
 
693 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0144893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1719  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.82 
 
 
688 aa  393  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3649  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.57 
 
 
721 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.495656  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4226  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.95 
 
 
690 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.41 
 
 
681 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.32 
 
 
707 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5474  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.66 
 
 
692 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.79 
 
 
678 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.33 
 
 
681 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5243  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.39 
 
 
765 aa  391  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.06 
 
 
674 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0691  hydantoin utilization protein A  40.78 
 
 
689 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.167885  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0176  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.67 
 
 
682 aa  388  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6223  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.44 
 
 
690 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0079  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.04 
 
 
687 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.09 
 
 
726 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.1 
 
 
657 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  36.38 
 
 
687 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.42 
 
 
684 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1980  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.99 
 
 
693 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  40.3 
 
 
660 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1913  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.45 
 
 
684 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0388506 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4428  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.41 
 
 
690 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2497  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.72 
 
 
719 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0398  hydantoinase/oxoprolinase  38.88 
 
 
1277 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2293  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.26 
 
 
672 aa  379  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2226  5-oxoprolinase  38.78 
 
 
680 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460045  normal  0.133433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0640  putative N-methylhydantoinase A  39.11 
 
 
672 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221754  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2035  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.95 
 
 
701 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2412  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.21 
 
 
662 aa  373  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0201127  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8488  Hydantoinase/oxoprolinase  36.32 
 
 
682 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2208  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.3 
 
 
688 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170446  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.56 
 
 
673 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1857  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.65 
 
 
674 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0444045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.63 
 
 
706 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4028  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.3 
 
 
711 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6260  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.94 
 
 
691 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00292738  normal  0.765217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.18 
 
 
684 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2647  hydantoinase/oxoprolinase  37.5 
 
 
678 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.59 
 
 
690 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0038  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.97 
 
 
661 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.99 
 
 
648 aa  366  1e-100  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.96856  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3416  Hydantoinase/oxoprolinase  37.43 
 
 
698 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1935  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.48 
 
 
690 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3097  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.57 
 
 
702 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.364987  normal  0.554031 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1127  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.61 
 
 
641 aa  366  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.814296  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0472  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.91 
 
 
687 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4389  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.1 
 
 
684 aa  363  4e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.43 
 
 
685 aa  362  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413249  normal  0.693617 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0425  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.82 
 
 
647 aa  362  1e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1060  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.32 
 
 
684 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0371  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.16 
 
 
707 aa  362  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4143  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.54 
 
 
702 aa  360  6e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.38 
 
 
692 aa  360  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>