38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3049 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  100 
 
 		 222 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  45.37 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  45.37 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  32.33 
 
 		 258 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  43.31 
 
 		 478 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  35.24 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  25.53 
 
 		 243 aa  94.7  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  33.93 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  35.09 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  31.51 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  36.62 
 
 		 176 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  38.76 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  31.74 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  28.64 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  26.82 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  42.53 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  31.16 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.97 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  38.82 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  38.38 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  38.38 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  38.38 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  38.38 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  38.38 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  38.38 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  38.38 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  38.38 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  26.49 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  25.13 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  27.14 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  41.3 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3132  hypothetical protein  34.11 
 
 		 163 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0956079  normal  0.131919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  35.09 
 
 		 171 aa  48.5  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3488  hypothetical protein  34.11 
 
 		 163 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0408329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4963  hypothetical protein  31.25 
 
 		 307 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  28.89 
 
 		 305 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2632  hypothetical protein  32.22 
 
 		 302 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>