74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3039 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 183 aa  346  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  44.2 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  38.46 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  37.21 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  36.99 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.54 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  27.74 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  34.92 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.09 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  26.52 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  34.92 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.82 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.35 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  32.35 
 
 		 161 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.13 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  34.13 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  34.13 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  34.13 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  34.13 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  34.13 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  34.13 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.09 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  30.25 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.25 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.25 
 
 		 164 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.01 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  28.99 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  34.31 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  35.04 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  35.04 
 
 		 235 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.87 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  25.74 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.94 
 
 		 173 aa  48.5  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.86 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  31.3 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0760  hypothetical protein  37.66 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168942  normal  0.059645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3562  type VI secretion system lysozyme-related protein  37.66 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  29.37 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  35.51 
 
 		 178 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3433  hypothetical protein  37.66 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.545337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.56 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  35.51 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  35.51 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  35.51 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  30.16 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  35.51 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  35.51 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  35.51 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.65 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  28.99 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  35.79 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  35.51 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.4 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  32.85 
 
 		 169 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  27.82 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  27.82 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  27.82 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  27.82 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4554  DNA replication/recombination/repair protein  26.81 
 
 		 133 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.36 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  32.82 
 
 		 182 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  28.12 
 
 		 172 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04157  hypothetical protein  28.08 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  28.46 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04195  DNA replication/recombination/repair protein  28.08 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  28.46 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  28.46 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3670  GPW/gp25 family protein  28.08 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0334382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>