101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3022 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  100 
 
 		 451 aa  906    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  32.01 
 
 		 529 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  25.46 
 
 		 370 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  34.45 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  34.45 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  24.94 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  34.76 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  35.26 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  26.13 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  25.5 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  29.07 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  37.89 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  24.66 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  24.93 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  25.25 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  35.87 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  35.87 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  32.8 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  24.18 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  24.18 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  22.43 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  32 
 
 		 195 aa  62  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  37.08 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  32 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  24.69 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  29.08 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  27.11 
 
 		 189 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  32.22 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  31.58 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  33.6 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  26.15 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  24.31 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  27.15 
 
 		 221 aa  57  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  29.58 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  30.6 
 
 		 422 aa  57  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  31.62 
 
 		 451 aa  57  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  34.29 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  32 
 
 		 234 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  33.87 
 
 		 235 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 196 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  37.61 
 
 		 193 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 235 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 191 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  22.47 
 
 		 426 aa  55.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  26.77 
 
 		 175 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 191 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  32.71 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 195 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  30.95 
 
 		 247 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  32.79 
 
 		 178 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  30.56 
 
 		 609 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  36.45 
 
 		 557 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  28.02 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  28.69 
 
 		 153 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  36.56 
 
 		 205 aa  51.6  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 190 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  39.56 
 
 		 192 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  39.56 
 
 		 192 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  50.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 192 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 192 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  29.17 
 
 		 192 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  38.46 
 
 		 192 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  27.33 
 
 		 196 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 200 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  31.03 
 
 		 579 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  34.92 
 
 		 270 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 185 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 587 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  26.19 
 
 		 606 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  34.41 
 
 		 184 aa  47  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  28.79 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  36.27 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.57 
 
 		 152 aa  47  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  27.74 
 
 		 190 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  32 
 
 		 220 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 440 aa  46.6  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 178 aa  47  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  32.61 
 
 		 558 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 237 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  32.61 
 
 		 558 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  32.61 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  27.78 
 
 		 185 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  25.44 
 
 		 185 aa  45.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  32 
 
 		 196 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 456 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  37.88 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  34.88 
 
 		 833 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 869 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  36.78 
 
 		 869 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 213 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  35.23 
 
 		 565 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 344 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  31.97 
 
 		 264 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>