20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2988 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2988  GTPase or GTP-binding protein-like protein  100 
 
 		 276 aa  507  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0195  GTPase or GTP-binding protein  33.48 
 
 		 421 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0041  hypothetical protein  27.88 
 
 		 439 aa  82.4  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.395847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0989  GTPase or GTP-binding protein-like protein  32.67 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0801  GTPase or GTP-binding protein-like protein  39.58 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1427  AAA ATPase  33.95 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1914  hypothetical protein  30.33 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0849  hypothetical protein  26 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0769566 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0084  hypothetical protein  32.46 
 
 		 353 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0398  AAA ATPase  26.92 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1123  hypothetical protein  31.41 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0075  hypothetical protein  31.25 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.109256 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0955  hypothetical protein  27.81 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0047  hypothetical protein  31.96 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3491  GTPase or GTP-binding protein-like protein  33.7 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2475  GTPase or GTP-binding protein-like protein  32.89 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1404  hypothetical protein  28.77 
 
 		 425 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1840  conserved hypothetical protein  24.48 
 
 		 360 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.545103  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2037  GTPase or GTP-binding protein-like protein  26.41 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.677011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30338  predicted protein  27.4 
 
 		 429 aa  48.9  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>