19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2938 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2938  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00388332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3591  hypothetical protein  69.46 
 
 
239 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1738  hypothetical protein  41.4 
 
 
215 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.240603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2372  hypothetical protein  37.33 
 
 
223 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0192707  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0622  hypothetical protein  36.1 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2327  hypothetical protein  34.88 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2830  hypothetical protein  35.75 
 
 
214 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1538  hypothetical protein  36.73 
 
 
250 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0721268 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2368  hypothetical protein  34.84 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3831  hypothetical protein  31.65 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.181238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3002  hypothetical protein  34.18 
 
 
223 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1915  hypothetical protein  32.53 
 
 
248 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.31153 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0636  hypothetical protein  37.63 
 
 
177 aa  91.7  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104231  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3502  hypothetical protein  29.41 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.014829  hitchhiker  0.000163275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1958  hypothetical protein  30.58 
 
 
216 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000494887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1965  phage related protein  29.74 
 
 
216 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0234296  normal  0.184059 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1041  hypothetical protein  27.84 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186926  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1711  conserved hypothetical phage related protein  29.8 
 
 
240 aa  68.6  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000232765  hitchhiker  4.3120600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0477  hypothetical protein  26.37 
 
 
171 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.369804  normal  0.245879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>