295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2866 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4491  sulfite reductase  81.78 
 
 
534 aa  904  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4954  sulfite reductase  81.78 
 
 
534 aa  904  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.526752  normal  0.219456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2866  sulfite reductase  100 
 
 
537 aa  1088  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890512  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5007  sulfite reductase  81.08 
 
 
535 aa  887  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125173  normal  0.198772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3748  sulfite reductase  88.52 
 
 
540 aa  938  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2298  sulfite reductase  82.9 
 
 
534 aa  884  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253537  normal  0.965047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1753  sulfite reductase  59.01 
 
 
539 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274813  normal  0.0164644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4232  sulfite reductase  59.62 
 
 
539 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4136  sulfite reductase  58.66 
 
 
535 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1784  sulfite reductase  57.88 
 
 
526 aa  596  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2498  sulfite reductase  57.45 
 
 
542 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3056  FAD-binding domain protein  42.78 
 
 
554 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1738  FAD-binding domain-containing protein  47.76 
 
 
659 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  45.99 
 
 
1409 aa  323  6e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0631  FAD-binding domain protein  46.17 
 
 
376 aa  313  6e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.346009 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  41.65 
 
 
600 aa  310  3e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2733  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  36.35 
 
 
584 aa  309  6e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.461724  hitchhiker  3.24313e-06 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  45.01 
 
 
1403 aa  304  3e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  45.1 
 
 
883 aa  303  4e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  44.2 
 
 
1401 aa  302  8e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  45.93 
 
 
1400 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  43.7 
 
 
1407 aa  299  7e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3790  FAD-binding domain-containing protein  45.26 
 
 
388 aa  299  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.146822  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  44.09 
 
 
1405 aa  299  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  45 
 
 
1397 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  45.34 
 
 
1418 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  45.34 
 
 
1418 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  45.34 
 
 
1418 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  44.84 
 
 
1427 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  45.34 
 
 
1418 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  45 
 
 
1397 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  45.34 
 
 
1418 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  45.34 
 
 
1418 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  45.34 
 
 
1398 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  43 
 
 
607 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  40.58 
 
 
599 aa  294  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  40.58 
 
 
599 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  40.58 
 
 
599 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  40.58 
 
 
599 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.58 
 
 
599 aa  293  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  40.58 
 
 
599 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  40.58 
 
 
599 aa  293  6e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  40.58 
 
 
599 aa  293  7e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.96 
 
 
1395 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  40.34 
 
 
599 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3227  sulfite reductase subunit alpha  40.82 
 
 
601 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000595634  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  43.72 
 
 
1383 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  45.45 
 
 
1395 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  45.45 
 
 
1395 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  45.45 
 
 
1395 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.76 
 
 
613 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  40.55 
 
 
599 aa  286  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3365  sulfite reductase subunit alpha  40.15 
 
 
609 aa  285  1e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.834699  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  34.02 
 
 
599 aa  283  4e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.33 
 
 
613 aa  283  5e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.76 
 
 
607 aa  283  5e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.56 
 
 
610 aa  283  6e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1906  FAD-binding domain protein  42.15 
 
 
628 aa  283  7e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  40.55 
 
 
599 aa  282  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  34.02 
 
 
599 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1305  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  42.13 
 
 
610 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  34.2 
 
 
599 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  39.2 
 
 
600 aa  281  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  39.75 
 
 
599 aa  280  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  39.26 
 
 
609 aa  279  9e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  43.94 
 
 
1338 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  35.89 
 
 
1342 aa  276  9e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  37.84 
 
 
623 aa  274  2e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  45.16 
 
 
1357 aa  274  4e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  39.81 
 
 
608 aa  273  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.21 
 
 
605 aa  273  7e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  44.83 
 
 
1396 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  43.58 
 
 
1257 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0932  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  40.05 
 
 
599 aa  270  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.520918  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2795  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.24 
 
 
614 aa  270  6e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0773977  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0402  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  37.6 
 
 
613 aa  270  7e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  37.5 
 
 
631 aa  270  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  39.2 
 
 
591 aa  268  3e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  41.9 
 
 
1384 aa  267  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  39.14 
 
 
614 aa  267  5e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  44.91 
 
 
1341 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  43.15 
 
 
1394 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  42.18 
 
 
602 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3442  sulfite reductase subunit alpha  39.36 
 
 
600 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0855  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.62 
 
 
604 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.111088  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3311  sulfite reductase subunit alpha  38.67 
 
 
612 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4759  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  37.38 
 
 
612 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0975  sulfite reductase subunit alpha  38.88 
 
 
600 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3080  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.62 
 
 
604 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274835  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0919  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.25 
 
 
599 aa  263  5e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0953  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.59 
 
 
599 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0944  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.25 
 
 
599 aa  263  6e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0892  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.89 
 
 
604 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3738  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  38.79 
 
 
607 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3416  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  32.08 
 
 
599 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  37.76 
 
 
599 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3193  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.62 
 
 
596 aa  256  1e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0218  sulfite reductase subunit alpha  35.25 
 
 
595 aa  255  2e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.180197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  42.26 
 
 
1405 aa  254  2e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  38.06 
 
 
598 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>