145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2833 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2833  superoxide dismutase copper/zinc binding  100 
 
 
177 aa  355  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0916793  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2378  superoxide dismutase copper/zinc binding  82.49 
 
 
177 aa  286  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4679  superoxide dismutase copper/zinc binding  75.62 
 
 
201 aa  254  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4310  superoxide dismutase copper/zinc binding  75.62 
 
 
201 aa  254  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.366806  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4827  superoxide dismutase copper/zinc binding  76.25 
 
 
201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.661461  normal  0.600787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3819  superoxide dismutase copper/zinc binding  72.3 
 
 
179 aa  218  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.130006  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2922  superoxide dismutase copper/zinc binding  60 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.719659  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0122  superoxide dismutase copper/zinc binding  50 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1699  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.79 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000210654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3011  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  40.22 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1561  superoxide dismutase copper/zinc binding  42.77 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.731272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2865  superoxide dismutase copper/zinc binding  43.33 
 
 
172 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2872  superoxide dismutase copper/zinc binding  46.48 
 
 
169 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1782  copper/Zinc superoxide dismutase  43.97 
 
 
156 aa  104  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4729  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.33 
 
 
179 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5039  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.67 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0195  superoxide dismutase, Cu-Zn  36.67 
 
 
179 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5046  superoxide dismutase, Cu-Zn  36 
 
 
179 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4777  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.33 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4617  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.33 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4639  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.33 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5018  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.33 
 
 
165 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5139  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.33 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5051  superoxide dismutase, Cu-Zn  35.33 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3518  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.33 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3135  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.36 
 
 
191 aa  95.1  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.310957  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0454  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.47 
 
 
190 aa  94.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.101401  normal  0.041937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2796  copper/Zinc superoxide dismutase  34.24 
 
 
169 aa  94.4  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.914684 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1796  putative copper/Zinc superoxide dismutase  32.7 
 
 
185 aa  91.3  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.749298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2345  superoxide dismutase  38.56 
 
 
178 aa  91.3  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0211561  normal  0.0730316 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0442  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.72 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.039325  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3220  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4070  superoxide dismutase copper/zinc binding  39.6 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.273253  normal  0.944661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0488  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.64 
 
 
172 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0817  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.18 
 
 
226 aa  89.4  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.509975  decreased coverage  0.0003056 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1634  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.76 
 
 
165 aa  88.6  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1161  superoxide dismutase copper/zinc binding  33.56 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.552065  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1009  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.23 
 
 
171 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0224  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.81 
 
 
172 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3597  superoxide dismutase, copper/zinc binding  33.55 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.592346  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3067  Superoxide dismutase  36.11 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00079657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0702  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.05 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123655  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2943  copper/Zinc superoxide dismutase  36.61 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.171551  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4681  Superoxide dismutase  35.17 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0852  superoxide dismutase, copper/zinc binding  38.89 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3711  superoxide dismutase copper/zinc binding  37.61 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3343  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  29.89 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0409606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2057  superoxide dismutase, copper/zinc binding  34.84 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0494601  normal  0.319354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4761  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.94 
 
 
179 aa  69.3  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1880  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.84 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03563  superoxide dismutase  32.69 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0125  superoxide dismutase copper/zinc binding  35 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.100957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3554  superoxide dismutase  34.09 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  0.247145 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1186  superoxide dismutase, Cu-Zn  32.21 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3942  superoxide dismutase copper/zinc binding  34.29 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379903  normal  0.128954 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03561  superoxide dismutase  37.5 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1900  superoxide dismutase, copper/zinc binding  28.8 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0124  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.84 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0952022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2581  superoxide dismutase copper/zinc binding  36.88 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152888  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1610  Superoxide dismutase  36.13 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3827  superoxide dismutase  32.26 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1801  superoxide dismutase  33.33 
 
 
172 aa  63.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0159903  normal  0.0303591 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1980  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.25 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0783595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3163  superoxide dismutase (Cu-Zn)  36.49 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2177  superoxide dismutase copper/zinc binding  35.46 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.0481765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001207  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.11 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4338  copper/Zinc superoxide dismutase  37.27 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06578  hypothetical protein  32.19 
 
 
170 aa  61.6  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0906  superoxide dismutase, Cu/Zn  30.51 
 
 
192 aa  61.6  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.381444  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1200  putative superoxide dismutase  33.54 
 
 
219 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2297  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.41 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2024  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.89 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000023752  hitchhiker  0.00000198076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1951  superoxide dismutase, copper/zinc binding protein  32.89 
 
 
170 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0285693  hitchhiker  0.00191784 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2125  superoxide dismutase, copper/zinc binding  32.89 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0013475  normal  0.0132534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3638  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.58 
 
 
173 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3728  superoxide dismutase copper/zinc binding protein  31.52 
 
 
244 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30470  CU-Zn Superoxide dismutase  34.67 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7975  Cu/Zn superoxide dismutase-like protein  29.19 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  0.114926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08070  superoxide dismutase (Cu-Zn)  31.86 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000475437  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1626  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.71 
 
 
177 aa  59.7  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2368  superoxide dismutase Cu-Zn precursor protein  34.19 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0422357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2757  superoxide dismutase, copper/zinc binding  36.36 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00492325  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1347  superoxide dismutase, copper/zinc binding  31.21 
 
 
183 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0161  copper/zinc superoxide dismutase  35.04 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000919214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2599  superoxide dismutase, copper/zinc binding  35.2 
 
 
239 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00595972  normal  0.45771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03307  superoxide dismutase, Cu-Zn  29.41 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00782096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12203  Copper/Zinc superoxide dismutase  34.71 
 
 
194 aa  57  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0538  superoxide dismutase copper/zinc binding  31.61 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0765812  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2022  superoxide dismutase (Cu-Zn)  33.1 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0511  superoxide dismutase [Cu-Zn] precursor  30.14 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.59112  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1610  superoxide dismutase  30.72 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.815221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2485  superoxide dismutase  31.51 
 
 
171 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.841642  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1550  superoxide dismutase  30.72 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1903  superoxide dismutase  30.72 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292339  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1537  superoxide dismutase  30.72 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19125  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1983  superoxide dismutase  30.12 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0141955  hitchhiker  0.00119703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1552  superoxide dismutase  30.12 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0496165  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1838  superoxide dismutase  31.33 
 
 
173 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01616  superoxide dismutase, Cu, Zn  31.33 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00181178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1994  Superoxide dismutase  31.33 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>