267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2805 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  77.78 
 
 		 208 aa  339  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  64.68 
 
 		 203 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  61.39 
 
 		 203 aa  271  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  60.89 
 
 		 203 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  60.2 
 
 		 203 aa  262  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  59 
 
 		 204 aa  259  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  58 
 
 		 204 aa  256  1e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  63.33 
 
 		 181 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  51.32 
 
 		 192 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  57.92 
 
 		 194 aa  222  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  55.19 
 
 		 194 aa  214  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  53.3 
 
 		 202 aa  215  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  46.7 
 
 		 203 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  52.85 
 
 		 203 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  50.54 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  35.75 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9030  hypothetical protein  44 
 
 		 241 aa  94.7  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  32.61 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  24.71 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  22.75 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  29.51 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  37.04 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  23.56 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  34.55 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  25.91 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2038  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.608826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  27.57 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  36.73 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  32.48 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  29.53 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  34.23 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  25.91 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1598  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  35.8 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0241286  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  27.93 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  24.26 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1242  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  32.63 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  31.62 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  36 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  30.28 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4275  isochorismatase hydrolase  28.48 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.41702  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  32.38 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  38.81 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  28.24 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  25.6 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  35.44 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  35.24 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  36.84 
 
 		 256 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  34.69 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  29.91 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  35.87 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 		 226 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  31.73 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0481  isochorismatase hydrolase  23.94 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1846  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0666128  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1893  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1827  isochorismatase hydrolase  36.26 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  21.05 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  24.75 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  25.48 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  25.73 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0508  isochorismatase hydrolase  36.11 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  30.49 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  37.63 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  29.9 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  30.99 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  30.99 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  38.55 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2732  isochorismatase hydrolase  29.55 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142839  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  30.86 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  30.99 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  31.65 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3089  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  27.45 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  29.29 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  29.36 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  30.61 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4038  isochorismatase hydrolase  34.78 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0636814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  27.13 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>