More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2680 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  100 
 
 		 213 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  66.2 
 
 		 212 aa  276  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  66.2 
 
 		 212 aa  273  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  60.1 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  59.11 
 
 		 208 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  57 
 
 		 207 aa  237  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  54.73 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  56.93 
 
 		 207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  58.29 
 
 		 207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  56.44 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  56.52 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  57 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  58.13 
 
 		 212 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  55.94 
 
 		 206 aa  228  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  56.5 
 
 		 211 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  56.65 
 
 		 212 aa  224  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  56.65 
 
 		 212 aa  224  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  56.65 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  54.85 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  55.88 
 
 		 206 aa  222  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  55.88 
 
 		 206 aa  222  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  54.41 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  57.5 
 
 		 206 aa  218  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  51.69 
 
 		 207 aa  217  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  51.22 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  53.3 
 
 		 201 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.33 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  44.14 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  44.91 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  43.56 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  47.4 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  45.79 
 
 		 248 aa  180  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  45.05 
 
 		 253 aa  180  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1445  phosphoglyceromutase  43.69 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0868062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  45.12 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  40.89 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  52.13 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  43.26 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  43.26 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  42.99 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  44.65 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  45 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  42.34 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  42.79 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  41.33 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  42.79 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  43.72 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  42.99 
 
 		 251 aa  174  7e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  42.79 
 
 		 250 aa  174  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  42.52 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  44.44 
 
 		 247 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  43.93 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  42.33 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  42.79 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.75 
 
 		 245 aa  171  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  43.93 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  42.99 
 
 		 251 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  42.99 
 
 		 251 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  43.46 
 
 		 247 aa  170  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  42.79 
 
 		 250 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  43.93 
 
 		 247 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  42.13 
 
 		 246 aa  169  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  43.93 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  42.33 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  42.33 
 
 		 250 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  43.46 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  42.99 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  43.12 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  41.86 
 
 		 250 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  42.99 
 
 		 247 aa  168  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  41.86 
 
 		 250 aa  168  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  41.05 
 
 		 227 aa  168  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  41.86 
 
 		 250 aa  168  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  40.09 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 270 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  43.26 
 
 		 270 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  42.06 
 
 		 234 aa  167  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  42.79 
 
 		 270 aa  167  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2293  phosphoglyceromutase  40.28 
 
 		 245 aa  167  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120355  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  41.59 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  41.2 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  42.33 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  42.33 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  42.52 
 
 		 293 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  45.07 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>