More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2577 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  39.35 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.91 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.09 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 634 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  27.78 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.07 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  38 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.33 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.25 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3301  methyltransferase type 11  35.65 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.34 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.34 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  30.69 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  28.7 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 1106 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  31.11 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  31.01 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.03 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2422  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.840321  normal  0.14599 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2716  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 		 733 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3487  methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.703718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.97 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 1032 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  38.3 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.14 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.76 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  31.67 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 305 aa  55.1  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  26.58 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  31.29 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  34.21 
 
 		 252 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.35 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  29.58 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0704  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0858444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.5 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3056  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000799279  normal  0.774854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  29.77 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  28.48 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 328 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  32.56 
 
 		 310 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.81 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1645  methyltransferase  28.83 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  27.18 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 173 aa  52.8  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  26.7 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.24 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.58 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0872  hypothetical protein  27.56 
 
 		 316 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  23.02 
 
 		 298 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.85 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>