More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2567 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2567  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 479 aa  948    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2695  type II and III secretion system protein  47.43 
 
 		 530 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  48.43 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4403  type II and III secretion system protein  40.96 
 
 		 495 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  40.94 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  42.54 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  40.67 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  39.73 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  39.95 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  40 
 
 		 461 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  36.84 
 
 		 497 aa  270  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  35.76 
 
 		 474 aa  264  2e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  37.09 
 
 		 466 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  35.23 
 
 		 482 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  38.34 
 
 		 620 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  34.97 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  36.26 
 
 		 490 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  35.76 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  35.76 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  35.76 
 
 		 482 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  31.92 
 
 		 483 aa  220  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  35.76 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  35.76 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  35.76 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  36.85 
 
 		 460 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  36.75 
 
 		 633 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  35.12 
 
 		 663 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  37.26 
 
 		 460 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  37.08 
 
 		 646 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  35.29 
 
 		 492 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  37.08 
 
 		 642 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  37.08 
 
 		 642 aa  217  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  35.93 
 
 		 460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  36.61 
 
 		 652 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  34.89 
 
 		 574 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  35.07 
 
 		 700 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  33.61 
 
 		 514 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  32.93 
 
 		 507 aa  210  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  33.82 
 
 		 634 aa  209  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  37.61 
 
 		 679 aa  209  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  31.58 
 
 		 478 aa  209  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  35.87 
 
 		 656 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  33.78 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  36.23 
 
 		 690 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  36.23 
 
 		 690 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  33.02 
 
 		 493 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  35.79 
 
 		 657 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  32.77 
 
 		 603 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  33.74 
 
 		 595 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  36.34 
 
 		 690 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  32.32 
 
 		 526 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  33.82 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  34.52 
 
 		 477 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  34.18 
 
 		 480 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  35.08 
 
 		 489 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  33.89 
 
 		 486 aa  196  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3713  type II and III secretion system protein  36.05 
 
 		 492 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  35.58 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  30.55 
 
 		 497 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  33.41 
 
 		 491 aa  190  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1057  type II and III secretion system protein  33.84 
 
 		 451 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  33.04 
 
 		 491 aa  189  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  32.4 
 
 		 487 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  32.52 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  32.97 
 
 		 484 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  30.91 
 
 		 571 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3204  type II and III secretion system protein  32.83 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.154583 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  31.24 
 
 		 487 aa  186  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  34.03 
 
 		 455 aa  186  8e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  33.18 
 
 		 501 aa  186  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  31.91 
 
 		 539 aa  186  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  31.7 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  31.73 
 
 		 493 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  31.48 
 
 		 453 aa  180  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  31.97 
 
 		 473 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  33.09 
 
 		 504 aa  177  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3791  type II and III secretion system protein  28.79 
 
 		 546 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.78564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  34.53 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  49.12 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55920  putative type II secretion system protein  49.12 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0275442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0217  component of type IV pilus  29.88 
 
 		 525 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  36.44 
 
 		 444 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0648  type II and III secretion system protein  37.72 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  39.47 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  39.47 
 
 		 432 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  39.47 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  39.47 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  39.47 
 
 		 432 aa  171  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  39.47 
 
 		 441 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  31.26 
 
 		 493 aa  171  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0481  type II and III secretion system protein  32.12 
 
 		 491 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  39.47 
 
 		 432 aa  171  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3352  type II and III secretion system protein  29.33 
 
 		 524 aa  170  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.78669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  34.8 
 
 		 468 aa  169  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  34.7 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  34.94 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0848  type II and III secretion system protein  40.6 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  39.42 
 
 		 469 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  34.09 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4358  type II and III secretion system protein  32.7 
 
 		 454 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.970058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>