More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2426 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2426  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
105 aa  213  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3907  transcriptional regulator, AraC family  84.76 
 
 
120 aa  185  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2036  transcriptional regulator, AraC family  83.65 
 
 
105 aa  183  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3895  transcriptional regulator, AraC family  81.73 
 
 
105 aa  180  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7632  transcriptional regulator, AraC family  81.9 
 
 
116 aa  179  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  74.76 
 
 
365 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0545  transcriptional regulator, AraC family  72.38 
 
 
136 aa  153  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1578  AraC family transcriptional regulator  65.05 
 
 
376 aa  144  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2269  transcriptional regulator, AraC family  66.99 
 
 
362 aa  143  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1582  AraC family transcriptional regulator  62.38 
 
 
367 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6972  hypothetical protein  57.28 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1286  transcriptional regulator, AraC family  59.8 
 
 
360 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0043  helix-turn-helix domain-containing protein  59.8 
 
 
360 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4253  helix-turn-helix domain-containing protein  57.28 
 
 
362 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0045  helix-turn-helix domain-containing protein  54.29 
 
 
373 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1288  transcriptional regulator, AraC family  55.88 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  53.4 
 
 
365 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0530  helix-turn-helix domain-containing protein  48.48 
 
 
354 aa  100  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  54.32 
 
 
390 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  53.16 
 
 
334 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 
339 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 
398 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  40.59 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 
339 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3638  AraC family transcriptional regulator  46.34 
 
 
360 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.632973  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 
334 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  50.63 
 
 
334 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2512  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
343 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477717  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5492  AraC family transcriptional regulator  45.12 
 
 
360 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504835  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3918  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
343 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.798133 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  53.62 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2336  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 
357 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  53.62 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3602  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
364 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  53.62 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3952  transcriptional regulator, AraC family  48.24 
 
 
351 aa  75.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 
353 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4967  AraC family transcriptional regulator  43.9 
 
 
360 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 
347 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3748  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 
350 aa  75.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.668173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0034  helix-turn-helix domain-containing protein  45.78 
 
 
366 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.131953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 
332 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3760  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 
356 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0904423  normal  0.271559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 
330 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1277  transcriptional regulator, AraC family  45.78 
 
 
366 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4600  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
355 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
364 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1917  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 
343 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
364 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 
341 aa  74.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3763  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
356 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.570935  normal  0.387809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5388  AraC family transcriptional regulator  41.05 
 
 
330 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74038  normal  0.0344366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 
347 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  45 
 
 
343 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5248  helix-turn-helix domain-containing protein  41.3 
 
 
330 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23442  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0976  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 
341 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5339  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000407019 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3508  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.878691  normal  0.0398628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6273  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294899  normal  0.494705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0519  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1196  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1556  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728217  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5340  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6762  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2682  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6507  transcriptional regulator, AraC family  42.17 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739448  normal  0.944873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0853  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4529  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
345 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  40 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 
337 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
373 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5360  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 
366 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.345948  normal  0.401219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 
359 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
336 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5781  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
348 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.436402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 
330 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5154  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
339 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
348 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  42.05 
 
 
362 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  41.98 
 
 
346 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1889  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 
360 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0152823  normal  0.720898 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6814  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
352 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1661  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 
333 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000279685  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3753  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 
362 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2629  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
382 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
336 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
345 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 
341 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2808  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 
337 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0112  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557465  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 
338 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2010  helix-turn-helix domain-containing protein  37.37 
 
 
362 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>