More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2261 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2261  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  100 
 
 		 472 aa  954    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5998  isopropylmalate isomerase large subunit  59.24 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00498287 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.69 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.66 
 
 		 473 aa  561  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  58.71 
 
 		 472 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1938  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.07 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3761  isopropylmalate isomerase large subunit  59.78 
 
 		 466 aa  555  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  59.83 
 
 		 470 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  61.29 
 
 		 467 aa  553  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3407  isopropylmalate isomerase large subunit  58.33 
 
 		 476 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  58.75 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  60.34 
 
 		 480 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3537  isopropylmalate isomerase large subunit  58.33 
 
 		 476 aa  548  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  58.75 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2938  isopropylmalate isomerase large subunit  58.33 
 
 		 476 aa  548  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  58.89 
 
 		 722 aa  547  1e-154  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  59.01 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  57.67 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  57.88 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  57.54 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  57.11 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  58.96 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  58.96 
 
 		 480 aa  544  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  58.21 
 
 		 472 aa  541  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  59.06 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  58.24 
 
 		 472 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  58.53 
 
 		 468 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  58.85 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  59.18 
 
 		 470 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  58.96 
 
 		 470 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  58.62 
 
 		 470 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0695  isopropylmalate isomerase large subunit  59.31 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  58.32 
 
 		 469 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  60.17 
 
 		 479 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0077  isopropylmalate isomerase large subunit  57.33 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  58.37 
 
 		 473 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0592  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.54 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  57.97 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  58.96 
 
 		 468 aa  535  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3585  isopropylmalate isomerase large subunit  57.33 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478946 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1812  isopropylmalate isomerase large subunit  60.04 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364535  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  56.36 
 
 		 772 aa  532  1e-150  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  57.11 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3526  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.11 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.85 
 
 		 470 aa  531  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  57.11 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00073  hypothetical protein  57.11 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  56.65 
 
 		 471 aa  532  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0743  isopropylmalate isomerase large subunit  57.54 
 
 		 466 aa  531  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  57.26 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  57.11 
 
 		 466 aa  534  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  58.1 
 
 		 469 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1223  isopropylmalate isomerase large subunit  57.66 
 
 		 473 aa  534  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10034  normal  0.0157674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.69 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  59.31 
 
 		 470 aa  529  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  56.57 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  56.57 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0079  isopropylmalate isomerase large subunit  56.9 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0775  isopropylmalate isomerase large subunit  58.75 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1729  isopropylmalate isomerase large subunit  56.57 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.405505  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  56.21 
 
 		 477 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  56.57 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  56.42 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2935  isopropylmalate isomerase large subunit  58.28 
 
 		 469 aa  528  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  58.61 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  56.14 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0075  isopropylmalate isomerase large subunit  56.9 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  56.36 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2591  isopropylmalate isomerase large subunit  56.84 
 
 		 471 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00933091  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  56.36 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  56.57 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  56.16 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3586  isopropylmalate isomerase large subunit  56.32 
 
 		 474 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  58.03 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0624  isopropylmalate isomerase large subunit  58.75 
 
 		 470 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001658  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  56.25 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  56.36 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  56.57 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0120  isopropylmalate isomerase large subunit  56.9 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  56.81 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  58.06 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0127  isopropylmalate isomerase large subunit  56.9 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0473  isopropylmalate isomerase large subunit  55.94 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  56.14 
 
 		 469 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  54.78 
 
 		 770 aa  526  1e-148  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0630  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  56.68 
 
 		 466 aa  528  1e-148  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0413  isopropylmalate isomerase large subunit  56.16 
 
 		 468 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  57.35 
 
 		 478 aa  527  1e-148  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  58.53 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  56.53 
 
 		 468 aa  527  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  56.68 
 
 		 466 aa  528  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00815  isopropylmalate isomerase large subunit  55.82 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0122  isopropylmalate isomerase large subunit  56.68 
 
 		 466 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.924094  normal  0.160243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  58.19 
 
 		 468 aa  527  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2916  isopropylmalate isomerase large subunit  57.54 
 
 		 470 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0123  isopropylmalate isomerase large subunit  56.68 
 
 		 466 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.610682  normal  0.713431 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0127  isopropylmalate isomerase large subunit  56.9 
 
 		 466 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.03719 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  56.1 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.134544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  57.88 
 
 		 470 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4234  isopropylmalate isomerase large subunit  55.82 
 
 		 474 aa  522  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>