More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2188 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  61.75 
 
 		 532 aa  654    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  76.82 
 
 		 534 aa  815    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 534 aa  1055    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  75.47 
 
 		 532 aa  800    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  75.47 
 
 		 533 aa  804    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  75.47 
 
 		 532 aa  800    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  61.19 
 
 		 531 aa  649    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  94.57 
 
 		 534 aa  1010    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  54.38 
 
 		 534 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  54.48 
 
 		 533 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  54.6 
 
 		 856 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  52.44 
 
 		 533 aa  538  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  52.75 
 
 		 533 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  52.1 
 
 		 532 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  52.56 
 
 		 535 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  53.55 
 
 		 533 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  53.73 
 
 		 533 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  50.46 
 
 		 856 aa  508  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  51.2 
 
 		 535 aa  504  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.94 
 
 		 853 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  45.62 
 
 		 556 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.69 
 
 		 848 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.32 
 
 		 845 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.19 
 
 		 849 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.13 
 
 		 844 aa  428  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.77 
 
 		 839 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.86 
 
 		 844 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  43.01 
 
 		 554 aa  415  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  44.1 
 
 		 531 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  46.81 
 
 		 554 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  46.49 
 
 		 844 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  43.16 
 
 		 554 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  42.16 
 
 		 554 aa  403  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  43.16 
 
 		 554 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  43.16 
 
 		 554 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  42.39 
 
 		 537 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  42.03 
 
 		 535 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.64 
 
 		 834 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  40.36 
 
 		 532 aa  385  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  40.69 
 
 		 551 aa  365  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  41.21 
 
 		 632 aa  361  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.7 
 
 		 846 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  41.02 
 
 		 632 aa  348  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  39.51 
 
 		 530 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  39.29 
 
 		 843 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  40.82 
 
 		 632 aa  347  3e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  40.96 
 
 		 533 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  38.81 
 
 		 532 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  38.28 
 
 		 533 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  39.82 
 
 		 530 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  41.57 
 
 		 636 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  37.86 
 
 		 532 aa  339  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  39.26 
 
 		 525 aa  339  7e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  40.74 
 
 		 640 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.23 
 
 		 846 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  36.65 
 
 		 501 aa  334  3e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  39.3 
 
 		 530 aa  333  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  40.43 
 
 		 626 aa  330  6e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  42.55 
 
 		 621 aa  329  8e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  40.24 
 
 		 625 aa  329  9e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  39.62 
 
 		 533 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  40.51 
 
 		 604 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  37.28 
 
 		 533 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  39.6 
 
 		 594 aa  320  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  39.6 
 
 		 594 aa  320  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  38.61 
 
 		 534 aa  319  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  39.6 
 
 		 532 aa  319  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  38.52 
 
 		 532 aa  317  3e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  39.84 
 
 		 626 aa  316  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  38.83 
 
 		 533 aa  316  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  35.13 
 
 		 508 aa  315  9e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.04 
 
 		 858 aa  316  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  38.72 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  38.29 
 
 		 531 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  39.32 
 
 		 502 aa  315  1.9999999999999998e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  39.21 
 
 		 627 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 		 633 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  38.08 
 
 		 524 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  34.73 
 
 		 505 aa  309  9e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  39.84 
 
 		 621 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4645  preprotein translocase subunit SecD  38.67 
 
 		 624 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  35.86 
 
 		 526 aa  307  3e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3885  preprotein translocase subunit SecD  38.52 
 
 		 625 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  39.19 
 
 		 609 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  38.39 
 
 		 533 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1982  preprotein translocase subunit SecD  38.1 
 
 		 618 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1977  preprotein translocase subunit SecD  38.1 
 
 		 618 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  36.47 
 
 		 614 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  38.94 
 
 		 623 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  35.53 
 
 		 526 aa  300  3e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  38.9 
 
 		 626 aa  299  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  39.13 
 
 		 681 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  35.95 
 
 		 616 aa  298  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  36.69 
 
 		 615 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  41.81 
 
 		 614 aa  297  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  37.55 
 
 		 620 aa  296  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  38.69 
 
 		 629 aa  296  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1696  preprotein translocase subunit SecD  37.76 
 
 		 618 aa  296  8e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3111  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 616 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  37.24 
 
 		 512 aa  295  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>