More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2168 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0365  aspartyl-tRNA synthetase  62.44 
 
 		 591 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.747846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3140  aspartyl-tRNA synthetase  64.11 
 
 		 623 aa  805    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545815 
 
 
-
 
NC_002978  WD0413  aspartyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 600 aa  669    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2541  aspartyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 595 aa  758    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0210193  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4005  aspartyl-tRNA synthetase  86.92 
 
 		 614 aa  1076    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_004310  BR0751  aspartyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 595 aa  760    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.220186  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0745  aspartyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 595 aa  760    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3864  aspartyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 590 aa  825    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0043  aspartyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 		 593 aa  787    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000554718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1016  aspartyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 608 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90482  normal  0.914473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1396  aspartyl-tRNA synthetase  73.04 
 
 		 597 aa  929    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0672  aspartyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 590 aa  669    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.301206  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1588  aspartyl-tRNA synthetase  67.5 
 
 		 590 aa  832    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.858986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4486  aspartyl-tRNA synthetase  87.58 
 
 		 604 aa  1075    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1519  aspartyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 605 aa  637    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000463103  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0815  aspartyl-tRNA synthetase  61.94 
 
 		 591 aa  736    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2465  aspartyl-tRNA synthetase  93.54 
 
 		 604 aa  1149    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.858075  normal  0.022913 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1320  aspartyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 604 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0251551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0868  aspartyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 		 596 aa  740    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.925972  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0932  aspartyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 		 605 aa  649    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000107292  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1251  aspartyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 596 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1469  aspartyl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 608 aa  658    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000021993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2072  aspartyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 606 aa  773    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3302  aspartyl-tRNA synthetase  66.23 
 
 		 607 aa  811    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2496  aspartyl-tRNA synthetase  67.28 
 
 		 590 aa  831    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1338  aspartyl-tRNA synthetase  63.11 
 
 		 593 aa  766    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.427897  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0334  aspartyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 590 aa  673    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3166  aspartyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 		 591 aa  717    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.178298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0209  aspartyl-tRNA synthetase  73.88 
 
 		 623 aa  946    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.789469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2336  aspartyl-tRNA synthetase  66.5 
 
 		 590 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.544435  normal  0.352116 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1104  aspartyl-tRNA synthetase  59.37 
 
 		 596 aa  734    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.507446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2947  aspartyl-tRNA synthetase  67.16 
 
 		 590 aa  835    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2557  aspartyl-tRNA synthetase  59.16 
 
 		 609 aa  719    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2111  aspartyl-tRNA synthetase  67.44 
 
 		 590 aa  833    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0802  aspartyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 595 aa  754    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336028 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0635  aspartyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 594 aa  711    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.312658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1751  aspartyl-tRNA synthetase  64.77 
 
 		 619 aa  771    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.96886  normal  0.294173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2168  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 604 aa  1236    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271234  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1122  aspartyl-tRNA synthetase  63.27 
 
 		 594 aa  772    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403181  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0504  aspartyl-tRNA synthetase  86.32 
 
 		 625 aa  1095    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0413061  normal  0.734988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2472  aspartyl-tRNA synthetase  61.94 
 
 		 591 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0952045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2364  aspartyl-tRNA synthetase  64.56 
 
 		 595 aa  768    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1258  aspartyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 		 605 aa  750    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000886805 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2633  aspartyl-tRNA synthetase  60.8 
 
 		 590 aa  734    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.530132  normal  0.0940983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3453  aspartyl-tRNA synthetase  67.44 
 
 		 591 aa  838    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0866598  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0450  aspartyl-tRNA synthetase  63.23 
 
 		 599 aa  759    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1650  aspartyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 		 606 aa  637    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2183  aspartyl-tRNA synthetase  62.94 
 
 		 591 aa  740    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.403701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1620  aspartyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 601 aa  646    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0865646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1592  aspartyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 601 aa  743    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409967  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4374  aspartyl-tRNA synthetase  87.09 
 
 		 604 aa  1078    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0477  aspartyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 588 aa  624  1e-177  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  unclonable  0.0000000218693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1543  aspartyl-tRNA synthetase  50.67 
 
 		 581 aa  596  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00178145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1351  aspartyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 600 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21332  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0950  aspartyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 		 603 aa  553  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3070  aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 588 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000092939  unclonable  0.0000000339544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1979  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 589 aa  523  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243263  normal  0.298313 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_612  aspartyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 598 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000641857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 597 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1411  aspartyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 		 594 aa  515  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00209555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3786  aspartyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 589 aa  509  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000017207  normal  0.0478066 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0643  aspartyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 598 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100017  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0708  aspartyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 598 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000309343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0968  aspartyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 592 aa  508  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.506019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 591 aa  502  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 592 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 586 aa  500  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 591 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 591 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1676  aspartyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 600 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 613 aa  497  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3302  aspartyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 589 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1621  aspartyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 599 aa  493  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.504505  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1821  aspartyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 		 607 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00584627  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 593 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 594 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 619 aa  490  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 592 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 		 596 aa  491  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 594 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 594 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1812  aspartyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 604 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0197544  hitchhiker  0.0000225826 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2354  aspartyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 595 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 617 aa  487  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 594 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 596 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 591 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 627 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 599 aa  486  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 596 aa  486  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000241419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51820  aspartyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 		 591 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000228175  hitchhiker  0.000212692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 590 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 614 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 599 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 591 aa  483  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1822  aspartyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 598 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 591 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3043  aspartyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 595 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 591 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 610 aa  483  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>