267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2159 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  84.12 
 
 
447 aa  675    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.553493  normal  0.136802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2159  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
441 aa  853    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301317  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0970  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  78.52 
 
 
441 aa  629  1e-179  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1040  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  78.75 
 
 
441 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0318758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  78.29 
 
 
441 aa  616  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.785158  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3124  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  75.81 
 
 
438 aa  591  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  64.37 
 
 
441 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.05 
 
 
445 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.445117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0333  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.91 
 
 
444 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3154  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.53 
 
 
446 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.11 
 
 
453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3518  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.57 
 
 
422 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.19647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1881  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.82 
 
 
441 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2373  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.09 
 
 
453 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3185  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.75 
 
 
441 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.551966  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  61.98 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301435  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2541  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.37 
 
 
429 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.802625 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2922  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  58.35 
 
 
438 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.748886  normal  0.0205845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2313  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  60.83 
 
 
453 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0857022  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2219  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  57.14 
 
 
438 aa  430  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.867959  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  59.26 
 
 
441 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0766234 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1693  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.18 
 
 
431 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.198297  normal  0.0303559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3359  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  55.45 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1889  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.95 
 
 
436 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.659609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2123  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.46 
 
 
435 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.226797  hitchhiker  0.00769752 
 
 
-
 
NC_004310  BR1296  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.91 
 
 
436 aa  359  7e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1259  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.68 
 
 
436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.913176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1745  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.6 
 
 
429 aa  355  8.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.138174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.8 
 
 
436 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0244195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2623  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.08 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0367802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3091  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.71 
 
 
464 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0224312  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.01 
 
 
450 aa  298  9e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2890  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.82 
 
 
463 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4184  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.35 
 
 
460 aa  289  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2329  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.42 
 
 
454 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.15 
 
 
464 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0470  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.44 
 
 
462 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.79 
 
 
488 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0926  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.5 
 
 
482 aa  280  3e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000234112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2607  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.11 
 
 
454 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.26 
 
 
464 aa  277  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1559  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.25 
 
 
454 aa  275  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3894  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.47 
 
 
460 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0538501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3810  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.5 
 
 
460 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2349  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  46.64 
 
 
441 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.328334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0262  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.26 
 
 
489 aa  266  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2056  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.8 
 
 
455 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.8 
 
 
454 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2119  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.8 
 
 
455 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0264172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0574  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.32 
 
 
467 aa  265  8.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1956  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.71 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2254  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.16 
 
 
538 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1850  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  44.72 
 
 
454 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.31 
 
 
502 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0183  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.32 
 
 
458 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.689135  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase CbiA  42.2 
 
 
457 aa  259  7e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.414294  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1001  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.14 
 
 
467 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3750  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.63 
 
 
437 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4034  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.24 
 
 
427 aa  256  7e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.53 
 
 
480 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0128  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.24 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.86 
 
 
460 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0635  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.18 
 
 
467 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873806  normal  0.509374 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1500  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.25 
 
 
507 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.35762e-18 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0431  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.86 
 
 
474 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.3 
 
 
474 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000112468  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2367  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.91 
 
 
444 aa  249  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1007  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.04 
 
 
442 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2994  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.83 
 
 
462 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2204  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.3 
 
 
459 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0036  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.4 
 
 
460 aa  247  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0277  glutamine amidotransferase  39.07 
 
 
435 aa  245  9e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2211  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.07 
 
 
459 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2715  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.83 
 
 
465 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000497962  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09381  putative cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.89 
 
 
475 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.101452 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_135  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.51 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2157  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.07 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2257  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.84 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3350  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.55 
 
 
461 aa  244  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.91386  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0243  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.56 
 
 
463 aa  243  5e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0327  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.37 
 
 
440 aa  242  9e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.580612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4466  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.66 
 
 
430 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.360132  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2136  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.22 
 
 
476 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.343335  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2370  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.84 
 
 
459 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1651  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.37 
 
 
436 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.961579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.73 
 
 
458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0437  cobrinic acid a,c-diamide synthase  42.6 
 
 
442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0472  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  42.6 
 
 
442 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2785  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing) / cobyrinate a,c-diamide synthase  40.93 
 
 
452 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0532  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.72 
 
 
443 aa  239  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1551  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.82 
 
 
435 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1187  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  39.85 
 
 
439 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5366  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.57 
 
 
465 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5859  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.96 
 
 
465 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1570  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.82 
 
 
434 aa  237  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239276  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1734  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.22 
 
 
455 aa  237  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1179  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.81 
 
 
464 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.28 
 
 
455 aa  236  7e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2491  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.07 
 
 
475 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0343  cobyrinate a,c-diamide synthase / hydrogenobyrinic acid a,c-diamide synthase (glutamine-hydrolysing)  37.29 
 
 
506 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>