30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2146 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2146  cobalt transporter, subunit CbtA  100 
 
 		 243 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2434  cobalt transporter, subunit CbtA  76.76 
 
 		 241 aa  296  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1440  cobalt transporter, subunit CbtA  59.52 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1443  cobalt transporter, subunit CbtA  59.04 
 
 		 255 aa  215  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.376445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1718  cobalt transporter, subunit CbtA  59.04 
 
 		 255 aa  214  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3112  cobalt transporter, subunit CbtA  57.49 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6984  cobalt transporter, subunit CbtA  38.22 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1309  hypothetical protein  42.45 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.236923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1272  hypothetical protein  42.45 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1874  cobalt transporter, subunit CbtA  41.78 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245777  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4714  cobalt transporter, subunit CbtA  39.56 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3101  cobalt transporter subunit CbtA, putative  39.74 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  40.43 
 
 		 228 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2525  cobalt transporter, subunit CbtA  33.47 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  40.17 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  37.39 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3775  cobalt transporter, subunit CbtA  41.98 
 
 		 242 aa  101  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.461264  normal  0.391945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  39.48 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2215  hypothetical protein  41.23 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3018  hypothetical protein  37.38 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.960935  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2301  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.395641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25940  hypothetical protein  39.49 
 
 		 364 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00053463  normal  0.0606013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2222  cobalt transporter subunit CbtA, putative  31.25 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2768  hypothetical protein  33.6 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.319102  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0161  possible cobalt transporter, subunit CbtA  32.19 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.528614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2154  hypothetical protein  32.39 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0542665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1015  hypothetical protein  28.28 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  29.03 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0446  hypothetical protein  27.82 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0964398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0481  hypothetical protein  27.82 
 
 		 279 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.844634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>