More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2131 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  89.51 
 
 		 459 aa  726    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 460 aa  905    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  89.57 
 
 		 460 aa  741    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  71.53 
 
 		 917 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  67.63 
 
 		 453 aa  568  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  67.27 
 
 		 443 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  62.64 
 
 		 912 aa  558  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  63.47 
 
 		 895 aa  548  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  61.89 
 
 		 441 aa  531  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  66.35 
 
 		 426 aa  513  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  57.56 
 
 		 905 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  62.47 
 
 		 452 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  61.61 
 
 		 893 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  60.25 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  60.38 
 
 		 413 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  63.64 
 
 		 424 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  61.03 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  50 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  50 
 
 		 426 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  50 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  50.13 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  50 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  49.26 
 
 		 422 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  48.88 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  50.24 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  50.24 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  50.24 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  50.24 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  50 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  50.24 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  48.88 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  48.4 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  48.37 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  50.87 
 
 		 409 aa  363  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  47.87 
 
 		 435 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 420 aa  360  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  48.64 
 
 		 440 aa  359  7e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  48.8 
 
 		 437 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 418 aa  346  6e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 417 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 409 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  43.3 
 
 		 418 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  42.73 
 
 		 444 aa  315  9e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  40.1 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  44.62 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  44.09 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 422 aa  294  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  36.73 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 472 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  43.43 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  43.18 
 
 		 424 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  43.18 
 
 		 424 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  42.46 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  39.87 
 
 		 506 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 411 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 389 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  29.24 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  29.24 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  29.24 
 
 		 389 aa  186  7e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  29.24 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  29.24 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  29.24 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  29.68 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.24 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  34.46 
 
 		 404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  33.42 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  33.15 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  33.42 
 
 		 404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  32.43 
 
 		 403 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 382 aa  170  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  31.72 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 404 aa  166  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  32.62 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  32.8 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  28.71 
 
 		 387 aa  164  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 411 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 397 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 406 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5440  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  31.37 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>