More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2110 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2110  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
456 aa  918    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1747  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  54.59 
 
 
467 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.79617  normal  0.600328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6824  coproporphyrinogen III oxidase  50.11 
 
 
450 aa  442  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.979073  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2504  coproporphyrinogen III oxidase  49.43 
 
 
469 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3872  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.01 
 
 
470 aa  439  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0435  coproporphyrinogen III oxidase  51.78 
 
 
450 aa  437  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0948  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  51.56 
 
 
490 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3273  coproporphyrinogen III oxidase  52.62 
 
 
448 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6285  coproporphyrinogen III oxidase  48.22 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180348  normal  0.950475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2555  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.8 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.674135 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1199  coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 
450 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00110576  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3865  coproporphyrinogen III oxidase  45.74 
 
 
449 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.955864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1485  coproporphyrinogen III oxidase  45.07 
 
 
449 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0666165  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4298  coproporphyrinogen III oxidase  46.43 
 
 
451 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1101  coproporphyrinogen III oxidase  45.11 
 
 
450 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00147181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1862  coproporphyrinogen III oxidase  45.64 
 
 
449 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3244  coproporphyrinogen III oxidase  46.31 
 
 
480 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2028  coproporphyrinogen III oxidase  45.96 
 
 
450 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1560  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.86 
 
 
444 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0541  coproporphyrinogen III oxidase  46.43 
 
 
454 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3814  coproporphyrinogen III oxidase  44.39 
 
 
449 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.156886  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2633  coproporphyrinogen III oxidase  45.77 
 
 
444 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0655  coproporphyrinogen III oxidase  45.54 
 
 
444 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.372227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0648  coproporphyrinogen III oxidase  45.31 
 
 
444 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308464  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1986  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  48.01 
 
 
454 aa  368  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  44.55 
 
 
458 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0531  coproporphyrinogen III oxidase  44.63 
 
 
450 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.44156 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0977  coproporphyrinogen III oxidase  44.13 
 
 
452 aa  348  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606099  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  42.76 
 
 
463 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  42.98 
 
 
463 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0601  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.61 
 
 
471 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  42 
 
 
456 aa  347  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2548  coproporphyrinogen III oxidase  47.04 
 
 
451 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.963821  normal  0.259779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  43.37 
 
 
463 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  43.37 
 
 
463 aa  346  5e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  43.27 
 
 
463 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  41.86 
 
 
458 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 
463 aa  343  5e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 
510 aa  342  7e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1962  coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 
452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.429779  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  42.6 
 
 
482 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 
494 aa  340  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  42.96 
 
 
460 aa  339  5e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2354  coproporphyrinogen III oxidase  44.26 
 
 
450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.148404 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1851  coproporphyrinogen III oxidase  45.66 
 
 
451 aa  339  7e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532026  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  43.32 
 
 
489 aa  339  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.5 
 
 
462 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  42.86 
 
 
494 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  42.35 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  42.35 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0317  coproporphyrinogen III oxidase  42.72 
 
 
452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  42.35 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  42.35 
 
 
464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
464 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0699  coproporphyrinogen III oxidase  44.26 
 
 
450 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2643  coproporphyrinogen III oxidase, anaerobic  40.53 
 
 
441 aa  335  7.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  40.41 
 
 
460 aa  335  9e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  41.91 
 
 
464 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  41.7 
 
 
461 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  42.08 
 
 
464 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  41.76 
 
 
461 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  40.64 
 
 
458 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  40.41 
 
 
458 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  40.41 
 
 
458 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.93 
 
 
463 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.93 
 
 
463 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0718  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  39.14 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  41.36 
 
 
500 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4823  coproporphyrinogen III oxidase  37.07 
 
 
456 aa  327  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  37.47 
 
 
472 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  36.96 
 
 
453 aa  326  5e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.27 
 
 
471 aa  326  6e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.54 
 
 
465 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  41.04 
 
 
483 aa  326  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  41.04 
 
 
483 aa  326  7e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  41.04 
 
 
481 aa  325  7e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  35.54 
 
 
465 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
483 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
481 aa  324  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  41.8 
 
 
460 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
483 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  41.46 
 
 
470 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  40.82 
 
 
483 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  36.19 
 
 
453 aa  323  5e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.02 
 
 
465 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  40.72 
 
 
460 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1131  coproporphyrinogen III oxidase  35.58 
 
 
451 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4884  coproporphyrinogen III oxidase  40.28 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0254001  hitchhiker  0.00000556041 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.34 
 
 
457 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1571  coproporphyrinogen III oxidase  35.63 
 
 
453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000177625  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  39 
 
 
463 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  40.77 
 
 
461 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  37.39 
 
 
469 aa  319  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  38.88 
 
 
478 aa  319  7.999999999999999e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.292242  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.01 
 
 
460 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  38.46 
 
 
473 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0659  coproporphyrinogen III oxidase  46.9 
 
 
453 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  40 
 
 
481 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  39.95 
 
 
457 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>