243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2106 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2106  protein of unknown function DUF59  100 
 
 		 134 aa  266  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.070916  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6120  hypothetical protein  67.91 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0673511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5673  hypothetical protein  66.92 
 
 		 130 aa  168  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2575  hypothetical protein  61.42 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.051429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  36.04 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  36.04 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  36.04 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  36.04 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  36.04 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  36.04 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  36.94 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  38.04 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  44.05 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  39.78 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  40 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  39.45 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  41.49 
 
 		 238 aa  70.1  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  42.27 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  39.42 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  42.55 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  39.81 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  40.86 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  37.11 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2388  protein of unknown function DUF59  41.57 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  36 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  34.74 
 
 		 105 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0929  hypothetical protein  36.73 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2070  protein of unknown function DUF59  42.22 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1140  hypothetical protein  42.7 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0364796 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  38.2 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1966  hypothetical protein  36.51 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246627 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  31.18 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2556  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  40.21 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  35.58 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  42.22 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  31.73 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  34.69 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  40.45 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  36.44 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  33.33 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2269  protein of unknown function DUF59  43.62 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.787383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  31.11 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4725  hypothetical protein  32.32 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  29.82 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2091  hypothetical protein  37.78 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3304  hypothetical protein  40.66 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2334  protein of unknown function DUF59  40.57 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.633871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  39.42 
 
 		 108 aa  63.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2448  hypothetical protein  37 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0276111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  37.62 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2504  protein of unknown function DUF59  39.33 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  36 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3077  hypothetical protein  41.11 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.214528  normal  0.195602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1832  protein of unknown function DUF59  34.04 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0938164  normal  0.975103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37.74 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1666  hypothetical protein  37.78 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.470727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  38.89 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  37.76 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5148  protein of unknown function DUF59  35.59 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2738  hypothetical protein  40.43 
 
 		 115 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  35.64 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  36.67 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  27.96 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  35.48 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  30.68 
 
 		 93 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2914  protein of unknown function DUF59  37.23 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  35.42 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  34.83 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1674  hypothetical protein  29.17 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0498751  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1805  hypothetical protein  31.68 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.752163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2033  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  34.02 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  35.05 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0896  hypothetical protein  34.07 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000151915  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11494  hypothetical protein  37.74 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144171  normal  0.147777 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0448  hypothetical protein  34.88 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2885  protein of unknown function DUF59  37.37 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  39.36 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2041  metal-sulfur cluster biosynthetic protein  37.11 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21890  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  35.96 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.904123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0433  hypothetical protein  34.88 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3672  hypothetical protein  36.79 
 
 		 119 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  31.25 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  33 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.9 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  34.41 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  35.51 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  34.41 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2441  hypothetical protein  37.08 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.310856  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2486  hypothetical protein  37.08 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.357516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2477  hypothetical protein  37.08 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  30.3 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0388  hypothetical protein  34.74 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.793437 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2989  hypothetical protein  31.91 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0927837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1677  protein of unknown function DUF59  34.95 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1420  hypothetical protein  37.89 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.095066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  34.07 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>