155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2061 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  100 
 
 
537 aa  1085    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  67.16 
 
 
537 aa  731    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  36.39 
 
 
860 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
535 aa  210  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  30.18 
 
 
1119 aa  207  5e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  33.14 
 
 
902 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
956 aa  176  8e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
994 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  28.61 
 
 
703 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
1340 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
456 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.51 
 
 
700 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
1106 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  29.53 
 
 
499 aa  137  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  29.32 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 
443 aa  128  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
824 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  30.19 
 
 
1837 aa  98.2  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
691 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  31.05 
 
 
442 aa  96.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
683 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1794  glycosyl transferase, group 1  24.4 
 
 
419 aa  95.1  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.164392  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
691 aa  94  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
691 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 
1156 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
389 aa  90.1  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  23.76 
 
 
892 aa  88.6  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2643  hypothetical protein  26.25 
 
 
429 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02426  putative glycosyltransferase  26.82 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1770  putative glycosyltransferase  24.22 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
1152 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  22.16 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0439  hypothetical protein  24.51 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  30.85 
 
 
429 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2710  hypothetical protein  26.18 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0543542  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2443  hypothetical protein  29.95 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000302372 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
1075 aa  78.2  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  22.31 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  30.77 
 
 
405 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
405 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  27.64 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  25.58 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  30.87 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_88208  predicted protein  29.1 
 
 
476 aa  73.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0321312  normal  0.112837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
404 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  30.91 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  30.87 
 
 
402 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  26.34 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 
274 aa  69.7  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  35.11 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  25.15 
 
 
402 aa  67.8  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
418 aa  67  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  25.91 
 
 
414 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
402 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2124  glycosyl transferase, putative  28.48 
 
 
415 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  25.13 
 
 
399 aa  65.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3617  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
415 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
402 aa  65.1  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
387 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 
376 aa  64.3  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  37.5 
 
 
418 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1665  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
415 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534865  normal  0.53265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
411 aa  63.9  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  37.5 
 
 
452 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
388 aa  63.5  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
413 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05740  glycosyltransferase  30.64 
 
 
420 aa  63.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
421 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1641  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.353523  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
409 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  29.64 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  33.03 
 
 
413 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  22.65 
 
 
397 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  23.35 
 
 
437 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 
396 aa  62  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  41.1 
 
 
363 aa  62  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
435 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  29.07 
 
 
399 aa  61.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
414 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
409 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  30.09 
 
 
401 aa  60.1  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 
422 aa  60.1  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  33.77 
 
 
422 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
410 aa  60.1  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30 
 
 
429 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
432 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
760 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1339  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
436 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.997916 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>